研究背景:羊水是一种复杂而动态变化的生物体液,其中含有大量由羊膜上皮细胞、胎儿组织、胎儿排泄物和胎盘组织产生的蛋白质。羊水可以为胎儿提供机械保护,营养以及胎儿生长和健康所需的其他分子。因此,羊水对于胎儿的发育至关重要,羊水是鉴别胎儿病理的潜在的主要生物标志物来源。研究方法:本研究共收集了 7名正常产妇羊水样本。首先从7例样本中每个取等量得到一个羊水混合样,通过免疫亲和去除柱去除14种高丰度蛋白,得到的流出组分,洗脱组分和原始混合蛋白3种样品分别进行酶切,二维液相色谱-质谱联用分析,最后得到的数据用于建立正常产妇羊水蛋白质组图谱。另外,7例羊水样本分别单独进行酶切,通过iTRAQ 8标进行同位素标记定量,将标记好的样品混合得到一个混合样,进行二维液相色谱-质谱联用分析,最后得到的定量数据用于分析个体间的差异。研究结果:本研究共鉴定到2881个非冗余羊水蛋白,其中基于峰强度半定量(iBAQ)方法定量到1624个蛋白,发现前20高丰度蛋白占羊水总蛋白的64%。基因本体分析显示羊水中胞外蛋白富集,包括一些胞外基质蛋白、胶原质蛋白等。IPA功能分析发现羊水蛋白主要与轴突导向信号通路相关性最高。7个羊水样本的个体间差异分析表明,个体间差异的中位数为0.22,90%定量蛋白的个体间差异小于0.46。iBAQ定量分析表明,个体间差异与技术重复和蛋白质丰度无关。GO分析结果显示,细胞内蛋白的CV相对高,细胞外蛋白的CV相对低。与其他体液相比,羊水蛋白质组个体差异大于脑脊液蛋白质组,小于尿液蛋白质组。结论:本研究建立了一个人类正常羊水蛋白质组的综合图谱。正常羊水蛋白质组鉴定数扩展到3170个,是目前羊水蛋白质组最大的数据库。同时,每个单独的羊水样本用iTRAQ定量方法分析个体间的差异。这是目前第一个关于正常羊水蛋白质组个体间差异的研究。这些结果将更好地为后续羊水蛋白质组研究和生物标志物的发现提供帮助。