导致宇宙加速膨胀的暗能量是现代宇宙学研究的重要前沿问题之一。超新星，宇宙微波背景辐射(CMB)，大尺度结构(LSS)等宇宙学观测，为暗能量的存在提供了坚实的证据。然而，暗能量的本质是什么?这仍是一个未解之谜。除了宇宙学常数外，动力学暗能量模型无论从理论角度，还是从与观测符合的角度，均具有很强的竞争力。对于动力学暗能量模型，其扰动的存在是必然的，因此深入研究理解暗能量扰动行为则是暗能量研究中不可或缺的一部分。对于结构形成线性阶段暗能量的扰动及其对宇宙学观测量的影响问题，人们已有广泛的研究。另一方面，对于在非线性结构形成过程中暗能量扰动性质的分析仍很欠缺。本论文即围绕该方面的问题展开研究。我们的工作主要包含两部分。在第一部分中，利用球塌缩模型，我们详细分析了Quintessence双指数势标量场的扰动行为，包括其随时间，空间的变化，对非线性结构尺度的依赖，对势参数的依赖等。这里，我们人为地引入了对于暗晕维理化的描述。为了更自然、准确地分析维里化过程的影响，在研究的第二部分，我们展开了数值模拟分析。在他人研究球塌缩过程的数值模拟方法的基础上，我们加入了流体暗能量成分，并对其扰动行为进行了深入分析。这一数值方法使得我们可以自洽地研究不同的暗能量成分(包括不同的物态方程，不同的声速等)的扰动特征。在未来的研究中，我们期待将这一数值方法结合进宇宙学数值模拟中，从而能够全方位地研究暗能量在不同时刻，不同尺度的扰动。