深海宏基因组克隆子次生代谢产物的研究

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微生物代谢产物具有巨大的化学多样性,是多种抗生素和其它药物的重要来源。由于现有培养手段的局限性,可培养的微生物不到微生物总数的1%,使绝大部分微生物资源的开发利用受到制约。深海微生物处于高压、低温、厌氧、极端pH梯度、高盐浓度、高金属浓度、无光照、寡营养、高卤素等特殊极端环境中,由于其生态环境的特殊性,决定了深海微生物具有一些特异的代谢途径和遗传背景,导致深海微生物次生代谢产物具有化学结构奇特、新颖,生物活性多样等特点。利用宏基因组学方法直接提取环境样品中混合微生物总基因组DNA,利用可培养的宿主细菌构建宏基因组文库,通过筛选寻找活性克隆子,并对其代谢产物进行研究,寻找活性代谢产物,能部分克服培养方法产生的偏差,获得新的科学发现和基因资源。
   本文对从深海宏基因组文库中筛选得到的具有抗肿瘤活性的QD4-1、11F6克隆子的代谢产物进行了系统研究,经大孔吸附树脂、硅胶柱、反相柱、制备液相等手段分离,从中分离得到14个化合物,并根据化合物的理化性质、核磁共振谱(1H-NMR,13C-NMR)及与文献报道对比鉴定了其化合物结构,分别为:尿嘧啶(1),胸腺嘧啶(2),2,4-喹唑啉二酮(3),环-(亮氨酸-酪氨酸)(4),异烟酰胺(5),环-(脯氨酸-酪氨酸)(6),环-(脯氨酸-缬氨酸)(7),环-(丙氨酸-异亮氨酸)(8),环-(苯丙氨酸-脯氨酸)(9),环-(异亮氨酸-缬氨酸)(10),1,2,2-三-1H-吲哚-3-基乙酮(11),N-[1-羟甲基-2-[4-乙酰氨基苯基]-2-(1H-吲哚-3-基)乙基]-2,2-二氯乙酰胺(12),环-(色氨酸-酪氨酸)(13),环-(苯丙氨酸-酪氨酸)(14)。其中化合物11和12是新化合物,体外活性试验显示化合物11具有良好的细胞毒活性。
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