MCM4影响肺腺癌总生存率分子机制的初步探索

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目的:初步探究MCM4 mRNA影响肺腺癌总生存率可能的分子机制。方法:分析TCGA数据库中肺腺癌RNA测序数据,将肺腺癌样本中上调的mRNA分别在10套GEO基因芯片数据中进行生存分析。生物信息分析方法探索MCM4基因上游相关的miRNA及lncRNA。双荧光素酶报告实验验证其直接调节关系,在肺腺癌细胞株A549及H1299中敲降ENSG00000234129.3,观察细胞迁移等生物学行为的变化。结果:MCM4 mRNA高表达时,在10套独立数据中均可导致肺腺癌的总生存下降(p均<0.05)。与MCM4显著线性负相关的miRNA为miR-338-3p(p<0.001)。与MCM4显著线性正相关的lncRNA为:ENSG00000228801.5、ENSG00000234129.3、ENSG00000259758.1(p均<0.001),并且利用miRanda及DIANA tool数据库证明了调控的可信性。利用qRT-PCR证实ENSG00000234129.3在肺腺癌组织独立样本及细胞株中均有较高表达。据此,我们选择ENSG00000234129.3→miR-338-3p→MCM4通路进行下一步研究。双荧光素酶报告实验验证了ENSG00000234129.3与hsa-miR-338-3p,及hsa-miR-338-3p与MCM4 mRNA存在直接靶向调节关系。在肺腺癌细胞株A549及H1299中敲降ENSG00000234129.3,与各自阴性对照组及空白对照组相比,每高倍镜下穿过小室的细胞数均明显减少(p<0.05),MCM4 mRNA的表达均显著下降(p<0.05),EMT过程相关蛋白E-cad及N-cad表达均显著下降(p<0.05)。结论:3条通路ENSG00000228801.5→miR-338-3p→MCM4、ENSG00000234129.3→miR-338-3p→MCM4、ENSG00000259758.1→miR-338-3p→MCM4与肺腺癌患者的总生存相关。ENSG00000234129.3与hsa-miR-338-3p,及hsa-miR-338-3p与MCM4 mRNA存在直接靶向调节关系。敲降ENSG00000234129.3后A549及H1299的迁移能力较对照组明显下降,MCM4 mRNA表达明显下降,且ENSG00000234129.3可能参与了肺腺癌细胞的EMT过程。
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