叶绿素活性荧光的分布和变化的研究对于了解叶绿素在河口的时空变化以及浮游藻类在河口水层中的丰度和分布,河口初级生产力变化,浮游藻类的生长状况及其与环境因子间的关系,河口及临近海域赤潮过程及成因等具有重要的意义。全文基于2009年和2010年两次在长江口海洋调查的数据,主要探讨了叶绿素活性荧光测定技术应用于长江口及邻近海域中,对Chl a的时空分布及其对环境因子变化的响应,环境胁迫对浮游藻类生长状况的影响等问题进行了相关研究。2009年航次主要围绕长江口羽状锋及邻近海域,基于环境因子的水平分布和垂直分布差异对叶绿素活性荧光的变化进行了相关调查分析,还对长江口的水体做了初步的水体健康评价。2010年航次是关于台风过境前后海洋混合层变动对水层中Chl a浓度、浮游藻类数量及生长状况影响的分析。论文取得的主要研究成果包括：1.叶绿素活性荧光参数Fo、Fm与Chl a浓度的关系对各个航次叶绿素活体荧光参数Fo、Fm和Chl a的分布特行了分析,发现其分布特征具有很高的相似性,同时相关性分析结果也显示叶绿素荧光Fo、Fm与Chl a浓度之间具有极显著正相关关系。证明Chl a浓度的高低与叶绿素活性荧光的强弱之间具有非常好的线性相关性。所以,叶绿素活性荧光Fo、Fm的强度是表征Chl a浓度的可靠指标,能够很好的在近岸和远海海域清澈水体中应用于Chl a浓度与分布的相关研究,特别是短时间内Chl a的时空变化。2.叶绿素活性荧光参数对浮游藻类生长状况的指示从长江口羽状锋内外Fv/Fm和Fv/Fo的差异以及台风过境前后垂直水层中Fv/Fm和Fv/Fo的变化结果可以看出,Fv/Fm和Fv/Fo对于藻类环境胁迫具有很好的指示作用。测量结果显示Fv/Fm和Fv/Fo对环境的变动很敏感,但将其应用于长江口及临近海域环境胁迫的相关研究时,需要结合环境胁迫主导因子的相关分析。3.基于叶绿素活性荧光参数的水体健康评价Chl a浓度是水体健康评价中的一个重要指标,水体的健康水平与Chl a的浓度高低息息相关。然而通过Fo、Fm、Fv/Fm和Fv/Fo的分布特征能够更加具体的区分出生态系统水平上的健康水体与亚健康水体。调查结果显示,Fm低于6000同时Fv/Fm高于0.6的清水海域为健康的水体。其表现为水体透明度好、营养盐含量不对浮游藻类生长构成限制且浮游藻类丰度适中的近岸和远海水体。虽然,这种评价方式有其不足之处,但是在对水体状况的快速评价和初步分析方面不失为是一种行之有效的方法。4.对海域内赤潮的观测利用叶绿素荧光可以准确的反映出赤潮发生的海域。认为海水温度在26℃左右,同时下部水层有上升流的存在的羽状锋区域,且具有冲淡水、外海海水、底层海水三者混合特性的海域是有可能会发生赤潮的海域。5.台风对藻类分布和丰度的影响台风过程能够缓解表层水体营养盐含量较低、比例失衡等问题。台风过程会使水体中的Chl a浓度发生明显的变化,Chl a浓度在台风过境后能够迅速增至较高水平,且浮游藻类的生长状况也得到了明显的改善。但这种变化是以台风前Chl a分布和浓度为基础的。