目的：利用硅藻18S rRNA基因检测判定实验家兔水中尸体的死亡原因。方法：将实验家兔随机分成溺死组、死后抛尸入水组及空白对照组；溺死组和死后抛尸入水组又分为两个亚组：长江水域组和护校河水域组。各组按实验设计分别提取死后家兔的肺、肝、肾、脑组织和心血，匀浆后，选用硅胶密度梯度离心法分离组织中的硅藻并采用Chelex-100法提取硅藻DNA，运用PCR技术扩增硅藻特异的18S rRNA基因片段，并使用琼脂糖凝胶电泳法、变性梯度凝胶电泳法、以及DNA测序技术三种方法对扩增结果进行检测并加以分析。同时使用传统的强酸消化法检测肺、肝和肾组织中的硅藻，并与PCR结果进行对比。结果：溺死组肺、肝、肾、脑组织及心血中硅藻检测多数呈阳性：肺（100%）、肝（75%）、肾（83%）、脑（75%）、心血（58.3%）；死后抛尸入水组仅在肺组织和肾组织中各检出2例和1例阳性；空白对照组各组织全部呈阴性。强酸消化法在溺死组肺、肝和肾组织中的硅藻检出率分别为：肺（83%）、肝（25%）和肾（16.7%），而死后抛尸入水组仅在1例肺组织中检出硅藻。结论：将PCR技术扩增硅藻18S rRNA基因片段运用到家兔水中尸体的死亡原因判断，其灵敏度和特异性均优于传统的硅藻强酸消化法。此检测方法对水中尸体的死因鉴定具有一定的应用前景。