美国国立科研机构是美国科研体系的四个组成部分之一,其对于美国科学技术的发展作出了卓越的贡献,其科研水平很大程度上能够代表美国科学技术的最高水平。科研经费是科研机构运行的“血液”,是支撑科研机构发展最重要的支柱之一。研究美国国立科研机构的经费管理能够获取美国国立科研机构当前经费管理的最新资料,并从中总结出一些共性的经验,为中国国立科研机构应对改革和发展过程中的挑战提供一些思考和借鉴,从而促进中国国立科研机构的深入发展。美国国立科研机构的经费管理在运行中秉持着重点论的管理逻辑,虽然涉及到经费的各个环节,但其重点关注的领域始终是经费配置、预算编制、执行以及审计环节。本文基于现实情境的考虑,选取科研经费配置、预算申请和执行、以及审计作重点研究。介绍了美国国立科研机构在经费配置、预算及审计方面的最新事实资料,并总结出了美国国立科研机构经费管理的一些特色与问题。本文按照成本的特性,从直接成本和间接成本两个维度对科研经费进行分类管理;在科研经费预算和执行过程中,按照科研经费的使用流程对科研经费进行全时序的管理;并通过内外结合的系统审计来保证科研经费的科学使用。通过对10所科研机构的实证分析,总结出了美国国立科研机构在经费管理方面的4大特点:明确的成本配置、精细的预算编制、规范的经费执行、全面的经费审计。并在此基础上实现经费管理经验的本土化,为中国国立科研机构的发展提供一些启示。