中国经济改革主要目标是调结构与稳增长,而结构调整的关键是用科技改造传统产业和鼓励高新技术企业的发展,医疗器械行业是最具有发展潜力的高新技术之一。高科技企业的创新能力的来源就是其拥有的研发团队,高科技企业如何更好的开发利用其人力资源,让他的研发团队充满活力创造力,绩效考核体系发挥着重要的作用。YTGS是一家自主研发关键核心技术的小型医疗器械高新技术企业,YTGS研发部员工绩效考核进行问题分析以及重新设计考核体系有着重要意义。本文以YTGS研发部员工的绩效考核为研究对象,运用现代绩效考核的基本理论,对公司研发部员工绩效考核的现状进行了全面系统的分析,针对该公司在绩效考核中存在的主要问题,在运用平衡计分卡的思想上,以目标管理为导向,团队考核与个人考核相结合,对绩效考核体系进行了设计,构建了比较完整的绩效考核体系,并从考核体系的实施和保障两个方面进行了完善、探讨。通过对YTGS绩效考核的研究,对于改进员工绩效、提高研发部门管理水平、实现研发部门的战略目标,具有重要的现实意义,为研发部门下一步合理推进绩效考核打下了初步的基础；同时也有助于中小高科技企业寻找和建立一套适合自身实际情况并有操作意义的绩效考核方法,为中小高科技企业进行绩效考核改革提供方案参考。