随着我国经济社会持续快速地发展，人们的生活水平显著地提高，越来越重视环境的污染问题，也越来越关注农业污染问题。由于长期以来在农业生产中化学用品如化肥、农药和地膜的大量使用，除了对水体、空气和土壤的污染外，还对人体有着严重的危害，给农业本已脆弱的生态系统带来了严重的后果。在建设我国新农村的过程中,加大力度扶持农业和保护农业生态环境,加强对农业污染的治理强度就显得极为必要。国内外关于农业环境防治与保护的研究，无论是控制农业污染的管理措施与政策法规，还是工程技术措施及经济管理措施，农户都是处于被动的选择地位，却极少有研究站在农户的角度，主动地选择和减少自身生产行为对农业环境的污染。因此，本论文更注重农户的个人主观能动性，即站在行为主体农户的立场，探讨引导农户主动参与到农业环境保护与防治之中。为了分析基于农业环境视角下，农业生产行为的影响因素，采用问卷调查方法，对阿克苏和喀什地区的农户进行实地调查，深入阿克苏的阿瓦提县、沙雅县和喀什的莎车县，共走访了英艾日克乡、多浪乡、托依堡勒迪镇、海楼乡、塔尕尔其乡、阿热勒乡和百什坎镇等7个乡镇下的共16个村和农场。本次问卷的主要内容包括农户基本情况调查、农户生产行为特征、农户对农业污染的认知及环境保护意愿三个部分。将对农业环境产生重要影响的棉农生产行为分解为化肥使用量状况，农药配制状况以及地膜的回收程度，分别使用Logistic回归模型进行实证分析，最终结果显示：农户化肥使用量状况、农药配制状况及地膜的回收程度受农户个体信息影响较小。其中，农户化肥的使用量受农户家庭人口数、棉花种植面积、是否从销售人员处了解信息、是否接受相关培训、对土壤状况的认知、对造成农业污染的认识与对化肥价格的反映等变量的影响较大；农药配制状况受到农户是否能看懂说明书、对选购农药毒性的了解、是否了解禁用农药与是否接受相关培训的影响较大；农户地膜回收状况受到家庭纯农人口数、地膜使用面积、种植模式、是否接受培训的影响较大。最后，对棉农的环境污染认知与环境保护意愿进行分析，从而了解到现阶段农户的环境保护意识与愿望。农户对化肥、农药和地膜的使用所带来的环境污染与危害有所认识，但是对环境保护的意愿不够。绝大多数农户表示对化肥、农药和地膜的使用造成的负面影响有所关心，但这并不会影响对化肥、农药和地膜的正常使用。结合南疆地区棉农环境生产行为影响因素分析和环境保护意愿分析结论，为促使南疆经济、社会、环境协调发展，除了工程措施以外，鼓励土地流转促使机械化大生产，规范农业化学品市场，建设有技术指导的农资店，加强农业生产培训，加强环境保护宣传教育，建设“合作社+环境检测”模式，以引导农户主动地参与到环境保护中。