本研究选择猪Ghrelin、Leptin、IGF-Ⅱ、IGFBP2、IGFBP3和SS基因为研究对象，首先用比较基因组方法，根据猪Ghrelin、IGFBP3、SS等基因以及其它物种如人、鼠、牛等同一基因的已知序列设计9对引物，以杜洛克猪基因组DNA为模板，对未知序列进行扩增和测序，以获取全长或较长基因序列，并提交Genbank收录；再以长白猪(L)、杜洛克猪(D)、蓝塘猪(LT)和五指山猪(WZS)各10个随机样本为SNP筛选模板，根据猪的6个候选基因的已知序列设计34对引物，PCR产物采用变性高效液相色谱(DHPLC)技术进行多态性检测，并用直接测序法确认SNPs及其在序列中的相对位置；最后选用8个RFLP标记对“长白猪×蓝塘猪”F2代资源群DNA样本进行基因型检测，并进行标记-性状的关联分析。使用的SNPs标记有：Leptin基因C3469T、C3952G、C4115T和C4227T位点，IGFBP2基因G1218T位点，IGFBP3基因A952G位点和A2670G位点，IGF-Ⅱ基因的A13518G位点。其中A13518G位点在长蓝F2代群体中出现偏态，未进行标记-性状的关联分析。