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茄子（Solanum melongena L.）具有丰富的营养成分与较强的保健功能,是世界上重要的蔬菜之一,同时也是我国种植面积较大,范围较广的果菜之一。为了明确茄子种质资源的遗传多样性与群体结构,丰富遗传背景狭窄的茄子种质资源以促进茄子改良,为茄子种质创新与品种选育提供参考依据。本研究基于21个表型性状对135份茄子种质进行遗传多样性分析;采用苗期人工接种黄萎病病菌对供试材料进行抗病性评价;采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳及Sanger双脱氧链终止法测序对茄子叶绿体与核基因组的SNP多态性标记进行筛选,利用最终得到的DNA片段对不同种的70份茄子材料进行亲缘关系与遗传多样性分析,主要结果如下:1.供试种质资源农艺性状具有丰富的遗传多样性,21个表型性状变异系数变幅为15.71%89.86%,遗传多样性指数变幅为0.3222.135。主成分分析将21个表型性状归纳为果形因子、色泽因子、果重因子、生长势因子、株型因子和果实商品性因子6个主因子,6个主因子累计贡献率达72.84%。通过聚类分析将供试材料分为4组,第i组为栽培茄+近缘野生茄（S.incanum L.）,第ii组为近缘野生茄,第iii组为大果型栽培茄,第iv组为紫色长条形栽培茄。2.黄萎病抗性评价结果显示,供试材料病情指数范围为5.00100.00,不同种之间抗性差异明显,并筛选出9份抗病（R）材料,6份中抗（MR）材料,11份耐病（T）材料,占供试材料的19.26%。其中,仅有3份抗性材料为栽培种,其余均为近缘野生茄,表明近缘野生茄有较强的黄萎病抗性。抗性材料国内外均有分布,国内的主要集中在南方,尤其是云南种质。3.设计已筛选出覆盖茄子10条染色体的11对多态性引物与1对叶绿体matK基因引物,对供试茄子种质进行遗传多样性与群体结构分析:共检测到1892个突变位点（464个单一突变位点、1131个简约性信息位点及297个插入/缺失）,11个核基因片段的核苷酸多样性Pi、中性检验Tajima’s D值、平均单倍型的多样性Hd分别为2.293×10-2、-1.99704（P<0.05）、0.547;种质间遗传距离K2P范围为00.1426,平均值为0.0234。其中,物种S.torvum S.与S.indicum L.的遗传距离为0.0533,物种S.incanum L.和S.melongena L.的遗传距离为0.0008;NJ聚类、核基单倍型谱系关系以及遗传结构背景分析均将供试种质分为4大类群。上述结果表明,参试种质种间遗传多样性水平较高,种内遗传多样性水平低于种间。同时,本研究从参与花青素合成、生长发育、开花调控等相关基因中筛选到多态性较高的核基因片段（FSB1、DFR、ccs52A、NAC、NAM、SP5G、FLC、Sm669、Sm12216）与一组鉴定茄属物种的DNA条形码（叶绿体基因matK片段+11个核基因片段）。表型聚类与DNA序列聚类结果均与茄子亲缘关系、果实性状存在一定的相关性。本研究结果为茄子种质资源优异基因挖掘、种质创新及新品种选育提供重要的理论依据。