flap核酸内切酶FEN1(flap endonuclease1)是RAD2家族的一种能够识别特异底物结构的核酶。FEN1具有三种酶活性:flap核酸内切酶(Flap Endonuclease，FEN)活性、5核酸外切酶(5-Exonuclease，EXO)活性和缺口依赖的核酸内切酶(Gap Endonuclease，GEN)活性，在DNA复制、修复以及维持端粒稳定性等方面发挥着重要作用。人们对FEN1在哺乳动物、酵母中的功能已经有了深入了解，但是拟南芥中尚无相关研究。　　我们在筛选遮荫反应相关基因的突变体时筛到了一个sav6(shade avoidance6)突变体，表现为下胚轴和根短小。通过图位克隆的方法我们将突变位点定位于At5G26680第九个外显子的最后一个碱基。该突变影响At5G26680的剪切效率，使得突变体中第九个内含子不能被完全切除，其翻译产物包含第九个外显子及其后内含子上的30个氨基酸。该突变可能导致具野生型SAV6蛋白功能的产物含量降低。　　对SAV6表达模式进行分析，我们发现该基因定位于根尖分生组织(root apicalmeristem，RAM)，茎尖分生组织(shoot apical meristem， SAM)，侧根原基，气孔母细胞等分裂旺盛的部位，在气孔中随着气孔的成熟逐渐降低，另外在表皮毛细胞中也有很高表达。　　蛋白序列分析结果表明SAV6和其他物种中的FEN1高度同源，进一步的体内、体外酶活检测表明SAV6具有双侧flap核酸内切酶活性和GEN活性，但是缺少EXO活性。在植物体内进行亚细胞定位也发现SAV6存在于细胞核，与hFEN1相同。　　say6具多种突变表型。首先，在黑暗及遮荫条件下，sav6下胚轴短小，该缺陷主要由细胞数目减少导致。其次，sav6根部发育缺陷包括根尖分生组织明显变小，成熟区细胞伸长受抑制，以及根尖静止中心(quiencent center，QC)细胞发育异常。另外，say6突变体对UV-C，喜碱树（camptothecin，CPT），博来霉素(Zeocin)等导致DNA损伤的胁迫表现出超敏的表型。 QRT-PCR结果表明sav6根尖细胞中和DNA损伤修复相关的基因，如RAD51(RADAIATION SENSITIVITY51), BRCA1(BREAST CANCER1 EARLY ONSET), PARP2(POLY-ADP RIBOSEPOL YMERASE2)表达量升高。由此可见，sav6突变体在没有外源试剂诱导DNA损伤的情况下，已然出现了DNA损伤，说明SAV6对维持DNA完整性有着重要的作用。　　DNA损伤的出现通常会在激活DNA修复系统的同时抑制细胞周期。我们发现编码细胞周期调控蛋白的基因SMR7在sav6突变体中的表达显著增加。SMR7过表达植株表现出RAM发育受抑制的表型，但是不影响静止中心细胞的发育。另外降低sav6突变体中SMR7的表达量会增加对Zeocin的敏感性，说明say6突变体中出现的DNA损伤有可能通过特异性地诱导SMR7的表达来抑制根尖分生组织细胞的分裂，降低突变细胞的增殖。　　严重的DNA损伤会诱导细胞程序性死亡，以防止突变细胞的进一步繁殖，以此来维持基因组的稳定性。已有的研究表明在拟南芥根尖分生组织细胞中ERF115作为转录因子激活PSK5的转录，表达PSKα前体分子。PSKα与其受体PSKR1结合后会促进QC细胞分裂。我们发现say6突变体中ERF115，PSK5，PSKR1的表达都增加，说明say6突变体中DNA损伤可能使得QC分裂加快。这一结果与我们观察到的say6突变体中QC发育受阻似乎是矛盾的。我们进一步推测，长时间激活DNA损伤应答系统，可能导致ERF115-PSK5途径持续激活，QC细胞保持在分裂状态，进而丧失了其作为极少分裂的干细胞组织中心的活性。我们用Zeocin，CPT等处理幼苗7天证明长时间DNA损伤会导致QC分裂进而丧失QC标记基因的表达。由此可见，SAV6通过维持基因组的稳定性保证根尖的正常发育。