中国制造业在全球供应链中占据着举足轻重的地位，而供应链信息系统的使用是供应链管理的一种重要方式。本文从控制理论和供应链信息系统出发，主要研究供应链管理中控制模式的特征和采纳决策，并据此讨论基于供应链信息系统的控制在供应链治理中的具体体现，比较它与传统控制的差异，并对基于供应链信息系统的控制与供应链合作伙伴关系之间的相互作用进行分析。　　本文在对现有研究成果进行文献综述的基础上，通过委托代理模型和多案例研究对不同的控制模式进行了比较。首先，通过文献研究发现现有研究缺乏传统控制与基于供应链信息系统的控制的比较分析，对基于供应链信息系统的控制的具体模式、特征、选择的影响因素等的研究不足，对合作伙伴关系是如何具体影响控制模式的选择的研究较少。其次，通过构建委托代理模型，从成本和收益的角度解释了大多数情况下供应链控制模式的选择;最后通过多案例研究，对基于供应链信息系统的控制和传统的控制的差异，以及基于供应链信息系统的控制的不同模式的差异的分析来说明模型中不同控制模式的成本和收益的具体构成。还通过案例探讨其他影响供应链控制模式选择均衡状态达成的因素，研究供应链合作伙伴关系对控制模式选择的影响，对如何推进供应链企业选择适合的控制模式进行了讨论。　　本文研究结果表明:第一，基于供应链信息系统的控制具有信息透明和信息可追溯的特征，与传统控制相比具有客观性。因此供应链信息系统除了具有运作价值和战略价值之外，还具有治理价值，能有效地降低合作双方的机会主义行为和提高契约的完备性。第二，不同控制模式的侧重点不同，传统控制模式以结果控制为主，结果信息控制的开窗口模式实现了更精准和低成本的结果控制，过程信息控制的开窗口模式实现了对部分过程信息的控制，而系统直连模式则真正实现了过程控制。第三，在企业供应链信息系统发展的每个阶段还会有不同的层面存在，在同一时期企业对于不同的供应商关系可能会选择不同的控制的模式，供应链合作伙伴之间的关系影响着供应链信息系统的使用深度，战略关系的供应链企业之间倾向于选择系统直连模式。不同控制模式达到均衡状态的驱动力是不同的，一种是障碍的推动，一种是未来利益的拉动。　　本文通过基于供应链信息系统的控制的研究对控制理论在供应链信息系统领域的应用进行了拓展，研究了供应链控制模式的特征和采纳决策，对供应链控制模式的选择，控制模式选择的影响因素以及控制模式选择的均衡状态的达成进行系统的讨论。对企业选择控制模式以及更好地治理供应链控制模式实现控制模式层次的跨越有一定的实践意义。