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第一部分:α干扰素治疗慢性乙型肝炎的药物遗传学研究研究背景乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染是全世界重要的卫生问题,中国是乙肝高发国家,HBV携带者有一亿二千万到一亿五千万。其中约有3000万为慢性乙型肝炎患者,这是我们国家沉重的经济、社会和卫生负担,我国每年用于治疗乙肝相关疾病的直接医疗费用约三百亿元人民币。α干扰素(Interfronα, IFNα)是目前治疗乙肝的一线用药,个体对IFNa的应答差异是影响IFNα临床用药的主要问题。本研究采用巢式病例对照研究设计,以干扰素抗病毒通路上的RNA特异性腺苷脱氨酶(adenosine deaminase, RNA-specific, ADAR)基因、α干扰素受体1(interferonαreceptor 1, IFNAR1)基因、蛋白酪氨酸激酶(Janus kinase 1, JAK1)基因和2′,5′-寡腺苷酸合成酶(2’,5’-oligoadenylate synthetase, OAS)基因为候选基因开展α干扰素治疗乙肝的药物遗传学研究。研究方法以246例IFNα治疗的慢性乙肝患者为研究对象。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)法检测ADAR基因的rs3738032, rs1127314, rs3766924位点,IFNAR1基因的rs2252930位点,JAK1基因的rs17127090, rs2780895, rs4244165, rs17127024位点,OAS基因的rs3177979, rsl293747, rs4767043, rs10849829位点等12个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点与α干扰素治疗乙肝疗效的相关性。应用SPSS 12.0软件包分析数据,应用SHEsis在线软件构建单倍型。研究结果经过6个月的治疗后,治疗的总应答率为68.7%(169/246),其中完全应答率16.3%(40/246),部分应答率52.4%(129/246)。完全应答组和部分应答组患者基线丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase, ALT)水平显著高于无应答组(189.0 IU/L, 156.5 IU/L,100.3 IU/L,P=0.001)。而完全应答者、部分应答者和无应答者间在性别、年龄和乙肝病毒基因型构成等方面,均未见统计学差异(P>0.05)。单位点分析表明以上12个位点的等位基因频率及基因型分布均与α干扰素治疗的疗效无关。单倍型分析表明由JAK1基因的rs17127090, rs2780895, rs4244165, rs171270244个位点组成的单倍型GCTG与α干扰素治疗无应答相关(11.9%vs.5.6%, P=0.016, OR=2.25,95%CI=1.15-4.40)。由OAS基因的rs3177979, rs1293747, rs4767043, rs10849829等4个位点组成的单倍型GTGA与α干扰素治疗无应答相关(16.1%vs.8.7%, P=0.015, OR=2.01,95%CI=1.13-3.58)。结论本研究提示较低的基线ALT水平、携带JAK1基因GCTG单倍型及OAS基因GTGA单倍型可能是α干扰素治疗无应答的危险因素。第二部分:ApoM基因及KIAA0350基因多态性与1型糖尿病的关联研究研究背景1型糖尿病(type 1 diabetes, T1D)是一类T细胞介导的由胰岛β细胞功能缺陷导致的自身免疫性疾病,在不同的国家和地区发病率差异很大,北欧国家的年患病率可为中国的300倍以上。目前有多项研究均表明宿主遗传因素与1型糖尿病的发病风险存在很大的关系。本文应用以人群为基础的病例对照研究方法,以载脂蛋白M (Apolipoprotein M, ApoM)基因及C型凝集素家族16成员A (C-type lectin domain family 16, member A, CLEC16A。又名KIAA0350)基因为候选基因,分析位于这两个基因上的多态性位点与中国汉族人群和瑞典人群1型糖尿病发生的关系,并对部分阳性位点进行了功能性验证。研究方法随机选取中国汉族及瑞典人群1型糖尿病患者和非糖尿病患者正常对照,开展关联研究。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism, PCR-RFLP)法检测ApoM基因及KIAA0350基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms, SNPs)位点。应用SPSS 12.0软件包分析数据,应用PHASE 2.1软件或SHEsis在线软件构建单倍型。构建含不同ApoM基因启动子区等位基因的pGL3-Basic重组质粒,采用双荧光素酶报告基因的方法检测其转录活性。研究结果1. ApoM基因多态性与T1D的相关性随机选取中国汉族1型糖尿病患者177例和非糖尿病患者正常对照316例,选择ApoM基因启动子区3个SNPs (rs805297(C-1065A), rs9404941(T-855C)及rs805296(T-778C))进行基因分型。发现C-1065A位点及T-778C位点与中国汉族1型糖尿病发病相关(P=0.007, OR=1.472, CI95%=1.112-1.948; P=0.002, OR=2.188, CI95%=1.338-3.581)。随后在瑞典人群中对上述两个位点进行了验证研究,选择1型糖尿病患者124例和非糖尿病患者正常对照101例,发现T-778C位点仍然与瑞典人群1型糖尿病发病相关(P=0.021, OR=2.865, CI95%=1.128-7.278)。报告基因分析显示,携带-778C等位基因的启动子活性是-778T等位基因的1.41倍(P=0.001)。2. KIAA0350基因多态性与T1D的相关性随机选取中国汉族1型糖尿病患者205例和非糖尿病患者正常对照422例,选择KIAA0350基因的2个SNPs (rs17802927, rs725613)进行基因分型。发现位于第19内含子区的rs725613位点与1型糖尿病显著相关(P=0.00007, OR=0.527,95%CI=0.383-0.726)。rs17802927, rs725613两个位点单倍型分析结果显示:GT单倍型在1型糖尿病组中的频率显著高于非糖尿病对照组(7.8%vs.1.8%, P=2.52×10-7),AG单倍型在1型糖尿病组中的频率显著低于非糖尿病对照组(9.3%vs.16.2%,P=0.00068)。结论本研究提示ApoM基因启动子区T-778C位点变异可影响启动子活性,并与中国汉族及瑞典人群1型糖尿病发病均相关。KIAA0350基因内含子区rs725613位点与中国汉族人群1型糖尿病发病相关。