肌肉生长抑素基因多态性与脂代谢状态相关性的研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:slylzz
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背景:随着现代生活习惯的改变、生活质量的提高,许多人开始变胖起来,与肥胖相关疾病的发病率也呈显著的增加,肥胖的发病机制逐渐成为热门的课题。1997年美国科学家发现肌肉生长抑素(Myostatin)及其基因(MSTN),这种蛋白能够抑制肌肉生长,目前研究者普遍认为肌肉是全身最大的耗能组织之一,肌肉生长抑素的缺乏可导致肌肉异常增生,增加肌肉耗能,调控能量的消耗,对认识肥胖的发病机制可能有重大的意义。2007年章振林等人在上海地区对核心家系的研究中发现,MSTN基因中+2278G>A位点的不同基因型间BMI水平存在显著的统计学差异,提示MSTN基因可能与肥胖发病具有相关性,但未见相关研究。目的:本研究的目的在于,对北京地区汉族人群MSTN基因的单核苷酸多态性(SNP)进行分析,探讨SNPs位点等位基因频率、基因型频率与超重肥胖的相关性;同时探索SNPs位点与受试者的身体测量数据、血清代谢相关指标等结果的相关性。方法:1、研究对象:(1)正常对照组:选择302名健康人作为正常对照组受试者,其中男性97人,女性205人。纳入标准:①查体:收缩压(SBP)<140mmHg,舒张压(DBP)<90mmHg, BMI<25Kg/m2;②实验室检查:血清中丙氨酸氨基转移酶(ALT)<100U/L、天冬氨酸氨基转移酶(AST)<92U/L、空腹血糖(FBG)<5.6mmol/L、总胆固醇(TC)<5.69mmol/L、甘油三酯(TG)<1.69mmol/L、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)<3.62mmol/L、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)>0.92mmol/L、血清肌酐(Cr)<132umol/L、血尿素氮(BUN)<7.14mmol/L。排除标准:①既往肝病史,如慢性病毒性肝炎、慢性活动型肝炎等;②任何一点不符合纳入标准。(2)超重肥胖组:597名超重或肥胖患者作为超重肥胖组受试者,其中男性284人,女性313人。其纳入标准:①查体:BMI≥25Kg/m2;②实验室检查:ALT<100U/L、AST<92U/L、FBG<5.6mmol/L、Cr<132umol/L、BUN<7.14mmol/L。排除标准:①既往肝病史,如慢性病毒性肝炎、慢性活动型肝炎等;②任何一点不符合纳入标准。2、MSTN基因SNPs位点的选择:(1)部分片段测序:从正常对照组中选取30个受试者进行MSTN部分片段测序(共11个片段),这些片段包含了章振林等人发现的所有SNPs位点。(2)选择SNPs位点:通过比对测序结果,统计SNPs位点,并以最小等位基因频率(MAF)大于5%或杂合度大于5%为原则,并结合SNPs位点对基因表达影响等因素进行筛选。3、MSTN基因SNPs位点的检测方法:(1)限制性内切酶片段法:利用DNAssist2.2软件对MSTN基因进行分析分析,寻找酶切位点,酶切结果可经电泳分辨。(2) Taqman探针法:根据SNPs位点信息设计探针与引物,经PCR扩增后对进行样本DNA的SNPs位点进行分型。4、统计分析方法:应用SPSS13.0软件对计数资料进行卡方检验,对正态分布的计量资料进行单因素方差分析,对非正态分布的计量资料进行秩和检验,当p值小于0.05认为具有显著的统计学差异。结果:1、MSTN基因SNPs位点的确定:对30个受试者MSTN基因的11个片段进行测序,发现所测片段中具有11个SNPs位点,其中第1外显子包含5629T/C位点,第2外显子包含rs35781413位点,第2内含子包含rs3791784位点、rs3791783位点、rs11681628位点、rs16832288位点,第3外显子包含10375G/T位点、10783G/T位点、rs3791782位点,3’UTR包含rs3791781位点,11个SNPs位点的MAF均大于1.0%,与美国国立生物技术信息中心(NCBI)SNPs数据库比对,5629T/C位点、10375G/T位点、10783G/T位点未见报道,其数值为SNPs出现位置,以基因全序列(由NCBI Mapview数据库检索"MSTN"获得)第一个碱基为起点。选取第2外显子rs35781413位点(G/A)、第2内含子rs3791783位点(A/G)和第3外显子rs3791782位点(A/G)进行下一步大样本病例对照关联分析。2、Hardy-Weinberg平衡检验:正常对照组中,MSTN基因SNPs (rs3791782位点、rs3791783位点、rs35781413位点)基因型的观测值与预期值之间无显著的统计学差异,p值分别为0.315、0.83、0.424,符合H-W平衡。3、超重肥胖组与正常对照组间关联分析结果:(1)超重肥胖组与正常对照组间等位基因频率的关联分析结果:在两组受试者间,MSTN基因的rs3791782位点(A/G)、rs3791783位点(A/G)、rs35781413位点(G/A),在等位基因频率方面未发现显著的统计学差异(p>0.05);(2)超重肥胖组与正常对照组间基因型频率的关联分析结果:在两组受试者间,MSTN基因的rs3791783位点基因型频率具有显著的统计学差异(p=0.032),rs3791782位点、rs35781413位点在基因型频率方面,未发现显著的统计学差异(p>0.05)。(3)超重肥胖组与正常对照组间基因模型中基因型频率的关联分析结果:显性模型中,在正常对照组与超重肥胖组受试者间,MSTN基因的rs3791782位点(AA型vs.AG型+GG型)、rs3791783位点(AA型vs.AG型+GG型)、rs35781413位点(GG型vs. GA型+AA型)基因型频率未发现显著的统计学差异。隐性模型中,rs3791783位点(AA型+AG型vs.GG型)在两组受试者间基因型频率具有显著的统计学差异(p=0.012),且GG型基因型比值比(OR)为0.466(0.255,0.854);rs3791782位点(AA型+AG型vs.GG型)、rs35781413位点(GG型+GA型vs. AA型)在两组受试者间基因型频率未发现显著的统计学差异(p>0.05)。(4)单倍体型分析:通过LD、R2检验,入选的三个SNPs位点不能形成连锁不平衡区,无法进行单倍体型的比较。4、不同基因型间计量指标的比较:将899位受试者各SNPs位点不同基因型间血清代谢相关指标、身体测量结果等数据进行统计学检验,结果如下:(1)rs3791782位点:该位点三个基因型间,LDL-C具有显著的统计学差异(p=0.003);(2)rs3791783位点三个基因型间,腰围、BMI、LDL-C、TC、TG等均具有显著的统计学差异(p值分别为0.041、0.009、0.005、0.030、0.046);(3)rs35781413位点三个基因型间,身高具有显著的统计学差异(p=0.046)。结论:1、MSTN基因rs3791783位点与超重肥胖的发生具有相关性,且具有GG型基因型的个体发病超重肥胖的风险降低;同时,MSTN基因rs3791783位点与腰围、BMI、TC、TG、LDL-C等具有相关性,基因型为GG型的受试者具有较低水平的腰围、BMI、TC、TG、LDL-C等。2、未发现MSTN基因rs791782位点与超重肥胖的发生具有相关性;在临床资料分析中,MSTN基因rs3791782位点与LDL-C血清水平具有一定相关性,其中基因型为GG型的受试者具有较低水平LDL-C。3、未发现MSTN基因rs35781413位点与超重肥胖的发生具有相关性;与前人研究结果相比较,两个研究结果之间的差异提示在两地人群在该位点可能存在遗传差异。
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