致病性金黄色葡萄球菌对家畜健康危害很大,本试验从广西地区患呼吸道疾病的山羊中分离鉴定获得了金黄色葡萄球菌,建立一种灵敏性高、特异性强的检测金黄色葡萄球菌的荧光定量PCR方法,并对SA GX2019株进行全基因组测序,挖掘其中的生物学信息,为进一步了解该菌,在生产上防治该菌引发的呼吸道疾病提供了依据。(1)采集广西各地区山羊养殖场中具有流鼻涕、咳嗽等呼吸道症状的山羊鼻拭子约300份,对其进行病原菌检测,并采用染色镜检、生化鉴定、PCR扩增和测序鉴定等方法,从来自梧州的20份山羊鼻拭子中分离得到纯化的金黄色葡萄球菌菌株,从8号样品中分离得到的金黄色葡萄球菌菌株命名为SA GX2019。(2)根据Gen Bank上已发表的金黄色葡萄球菌nuc基因序列设计引物,建立实时荧光定量PCR检测方法。本研究建立的方法,其标准曲线的决定系数R~2=0.9798,斜率Slope=-2.9858,扩增效率E=116.2%,最低样品检测浓度为1×10~1 CFU/m L。试验结果表明该方法敏感性高,特异性强,重复性好。应用建立的荧光定量PCR检测方法与普通PCR检测方法对比,结果显示荧光定量PCR方法的检出率比普通PCR方法高13.33%,有利于临床检测的应用。运用本试验建立的荧光定量PCR方法可准确地鉴定金黄色葡萄球菌。该研究成果可为呼吸道金黄色葡萄球菌感染的诊断和防控提供技术支撑。(3)对SA GX2019株全基因组测序分析结果显示,其基因组全长2773319bp,GC含量33%;预测到基因2686个,基因占比84.08%;对全基因组进行了CRISPR预测及COG、GO、KEGG注释等生物信息学分析。预测到t RNA28种,56个,r RNA3种,7个。本研究从生物信息学角度挖掘了该致病菌株的关键生物学信息,为后续针对广西地区该病原菌的诊断、耐药基因等进一步研究奠定基础。