随着国家转基因重大专项棉花项目的开展，越来越多的转基因棉花新品种投入到大田释放和田间试验阶段，针对棉花生育期间两种毁灭性重大病害——棉花枯萎病以及棉花黄萎病，已有许多转基因抗病棉花问世。在新品种大规模商业化推广前需要进行品种的抗病性检测，要保证转入的基因可以在棉株体内表达且遗传稳定，达到比较理想的抗病效果。除了抗病性，越来越多关注到转基因棉花的种植带给环境的影响，所以需要进行转基因棉花新品种的环境安全评价，检测其可能带来的负面影响，比如生存竞争、对生物多样性的影响等。本研究有一转基因抗病棉花新品种，以中棉所75号和本地常规棉花品种鲁棉研36号（豫棉21号、国审棉958等）为对照，从盆栽接种病原菌的发病情况、主要生理生化指标的变化、组织提取液抑菌性、根际土壤病原菌分离、生物多样性等五个方面研究了转基因抗病棉花新品种对两种主要病原菌的抗性程度及其种植对土壤生态系统中微生物及地上部节肢动物多样性的影响。为我国转基因棉花的种植及安全评价提供参考。研究结果如下：1.温室中进行棉花盆栽试验，采用浸根法、灌根法、伤灌根法、叶片针刺涂抹法四种不同的方法接种病原菌，探究转基因抗病棉花对棉花枯萎菌(Fusariumoxysporum.sp.vasinfectum)和棉花黄萎菌(Verticillium dahliae Kleb)的抗性。结果显示，只有叶片针刺涂抹法见效快且效果明显，转基因抗病品种较两种对照品种显示出了较好的抗病性。2.对三种棉花的苗期植株接种棉花枯萎菌和黄萎菌后，测定其可溶性蛋白含量及三种主要防御酶（POD、SOD、PAL）活性，结果为，转基因抗病棉花和鲁棉研36号的可溶性蛋白在接菌初期呈现出轻微的降低趋势，分析为蛋白质分解促进其他植保物质生成；接种两种菌后几种酶活的变化趋势相似，先增后降，转基因抗病棉花材料的酶活性变化快，峰值高。为转基因抗病棉花品种的抗病性鉴定提供参考指标。3.提取三种棉花的新鲜组织液，对棉花枯萎菌和黄萎菌两大主要病原菌进行了抑菌实验，出现抑菌圈，初步表明转基因抗病棉花的组织提取液对棉花枯萎菌和黄萎菌有一定程度的抗性作用。4.分别采集三种棉花生育期五个阶段的根际土壤，使用选择性培养基分离棉花主要病原菌，结果一共分离到9株镰刀菌，经分子学鉴定，其中的4株尖孢镰刀菌均不是在转基因抗病棉花根际土壤中获得；未从根际土壤中分离到轮枝菌属和丝核菌属真菌。同时，试验田中各品种长势良好，未发现规模性病害，仅在后期有青枯病的发生。2013年试验田调查结果为转基因抗病棉花耐枯萎病、高抗黄萎病。5.调查试验田中转基因抗病棉花材料等对根际土壤微生物多样性及地上部节肢动物多样性的影响。利用BIOLOG技术对三种棉花生育期间五个阶段的根际土壤微生物群落功能多样性进行了研究，对比发现，转基因抗病棉花材料的根际土壤微生物群落多样性丰富，也表现出了良好的均匀度。在优势物种之间存在差异，表明不同品种棉花的根际土壤微生物均存在着不同的优势种群。在出苗期至收获期之间的棉花的各项指数有差异，而在出苗期和收获期，均匀度和丰富性指数无显著性差异。同时，对节肢动物多样性的调查结果未发现转基因抗病棉花对棉田生物多样性有明显影响。