合成小麦初生根数目QTL定位及TaMYBX分子鉴定

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chengbocc
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根是植物主要器官之一,谷物中的根是摄取水分和养分的主要通道。根的构型影响小麦在土壤中吸收水分的时间和范围从而影响小麦产量,初生根的数目则是影响苗期根构型的主要因素之一。本论文利用WinRHIZO根系扫描系统对合成小麦(SHW-L1)和普通小麦川麦32(CM32)的重组自交系(HAI-120)苗期的初生根数目进行统计(三次重复),结合660K小麦SNP芯片构建的遗传图谱对其控制基因进行遗传定位。鉴定了位于染色体1B、3A、6A、6B、6D上的6个QTL位点,分别命名QRN.sicau-1B、QRN.sicau-3A、QRN.sicau-6A、QRN.sicau-6B.1-2、QRN.sicau-6D。QTLs的表型变异率在10.2~15.8%之间。其中QRN.sicau-1B表现出负加性效应,即对性状的增加效应来自SHW-L1,解释了15.8%的表型变异,为主效QTL。结合SHW-L1、CM32不同时期、组织的RNA-seq数据,于距离QRN.sicau-1B位点12.6Mb位置挖掘到在SHW-L1,CM32中表达有差异的候选基因TaMYBX。TaMYBX全长3697bp,有3个外显子2个内含子,编码一个R2R3型MYB转录因子。系统进化分析显示该基因在1B染色体上特异并具有3个拷贝,来源于野生二粒小麦(Triticum turgidum ssp.dicoccoides)。SHW-L1、CM32中该基因序列无差异,而实时荧光定量PCR分析表明该基因主要在SHW-L1发芽后48h-7D的根尖中高表达,推测该基因可能与小麦初生根数目有关。TaMYBX的2个拷贝在抗穗发芽QTL位点PHS.sicau-1B对应的中国春物理图谱区间内,但TaMYBX不是PHS.sicau-1B的候选基因。
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