近年来,随着我国交通运输行业的不断发展,集装箱多式联运这一种快捷有效的运输方式正在快速地发展,集装箱运输己一改传统的码头作业、港到港作业和站到站作业等单一运输方式,而是转向综合一体化的网络发展,集装箱多式联运系统化、网络化越来越多地得到重视。在集装箱运输网络系统中,集装箱从货主手中经内陆中转站、喂给港、枢纽港运输,然后运往海外是集运的过程,而货物从集装箱船舶到达港口卸货、发往喂给港、内陆中转站,直至送抵货主手中是疏运的过程,二者方向相反,原理相似。集装箱在枢纽港、喂给港、中转站和货主等几层节点中,通过不同运输方式流动,实现多式联运。所以纵观整个多式联运系统,采用整体的思想就显得尤为重要。通过对多式联运系统整体的把握,合理利用运输网络的资源,把整体资源优势整合起来,就能更好地利用现有的基础设施,以形成布局合理、运作高效的运输网络,这对加快物流行业的不断发展,优化资源配置,提高经济运行质量等方面都具有十分重要的意义。本文首先介绍了集装箱多式联运货流分配问题的相关理论,然后提出了超网络方法,构建基于此的多式联运货流分配问题模型,该模型从集装箱运抵港口开始,把枢纽港口、喂给港口和内陆中转站看成三层节点,每层节点有其自己的最优目标函数,但只有各层节点间达到整体的最优时候,整个多式联运系统才能达到均衡,引出该模型的整体优化条件。引入变分不等式理论,将决策者最优函数化为变分不等式,然后实施改进后的投影算法,得到了超网络中个体决策者间的最优货流量。最后通过对国内港口和内陆中转站的实例进行了验证,运用MATLAB软件编程计算,并对结果进行分析,求得的货流分配量较合理,可以作为集装箱多式联运货流分配的决策参考,表明了理论的可操作性和模型的合理性。