CTCF对HIV复制影响及机制探究

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CTCF是具有11个锌指结构的CCCTC DNA结合因子。CTCF结合具有保守性。CTCF最开始被认为是绝缘子,不断发现CTCF参与印记、X染色体失活、可变剪切、RNA结合、参与DNA病毒的潜伏与激活的过程。CTCF敲低后,沉默染色体的H3K27me3在全基因组降低,而HIV整合至宿主的基因组的过程也涉及到染色质的沉默,于是本实验探究CTCF参与限制HIV的感染。  在C8166 T淋巴瘤细胞中,运用慢病毒敲低CTCF,感染HIV-1ⅢB,发现病变的合胞体数(CPE)敲低组比阴性对照组的有明显的升高。在C8166过表达系统,抑制效果达到60%。  CTCF调控抗病毒相关基因。在敲低组加HIV-1ⅢB与敲低control组加HIV-1ⅢB,改变倍数如下,IFNβ:0.22,ISG15:0.61,IRF7:0.93,OASL:0.40,CXCR4:2.05,Mx2:0.74,TRIM5α:3.14。IFNβ、ISG15的下调达到极显著,IRF7、OASL、Mx2也下调,CXCR4、TRIM5α上调。在HeLa细胞HIVGFP假病毒系统,IFNβ、ISG15、IRF7、OASL、TRIM5α改变不显著。  CTCF不限制HIV在逆转录阶段。运用siRNA1敲低CTCF,并用HIVGFP感染细胞,GFP的表达量敲低组是对照组的2倍。但是Late-RT qPCR中,逆转录晚期产物敲低组与对照组没有显著差异。  CTCF参与HIV的转录调控。TZM-bl LTR启动子中敲低CTCF,敲低组比对照组转录的luciferase增加了10%。TZM-bl中过表达CTCF,过表达组比对照组luciferase的表达下降了50%。在假病毒HIVGFP系统中进行ChIP实验,CTCF结合在HIV LTR的启动子区域,敲低以后,CTCF的结合比对照组减少了55%。同时,敲低CTCF后,PolⅡ ser2P在+1-+39的停顿,敲低组是对照组的7.49倍,说明CTCF影响HIV的转录的起始增强,并且通过与PolⅡ的有效转录相互作用。  综上所述,本研究发现了CTCF抑制HIV的感染,CTCF参与抗病毒基因的调控,CTCF通过结合在HIV的LTR的启动子区域而沉默转录,并且与PolⅡ ser2P相互作用共同限制HIV转录。
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