PLCE1基因多态性与结直肠癌发病关联性研究

来源 :河北医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yiyiyaya13575
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目的:本研究皆在探讨人磷脂酶Cε1(Phospholipase C epsilon-1,PLCE1)基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)两位点的单核苷酸多态性(single nucleotide ploymorphisms,SNP)与结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)的关联关系,为结直肠癌高危人群筛查预警,旱期诊治及个体化预防等策略提供一定的遗传学依据。方法:通过病例-对照研究方法收集2012年2月-2015年2月间就诊于我院的240例CRC患者的病例资料(其中直肠癌138例,结肠癌102例),并作为病例组,同时收集同期就诊于我院和147例健康人群资料,作为对照组;记录所有研究对象的年龄、性别、吸烟史、饮酒史及肿瘤家族史等信息;通过蛋白酶K法提取研究对象白细胞中的DNA,采用PCR-LDR法对样本基因rs2274223(A/G)、rs17417407(G/T)两位点进行基因型及等位基因分析,分别比较两个SNP位点不同等位基因及基因分型与CRC关联关系。应用SPSS17.0软件对实验数据进行处理,采用χ2对两组研究对象进行Hardy-Weinberg均衡性检验,以确定病例组与对照组之间有无选择性差异。采用χ2检验及t检验对两组研究对象的人口学资料进行统计分析,采用χ2检验对两组之间的基因型和等位基因型分布分别进行比较分析,采用EH软件和2LD软件对两组研究对象进行单体型频率和连锁不平衡分析。应用非条件Logistic回归法计算表示相对风险度的比值比(odds ratio,OR)及95%可信区间(confidence interval,CI)。检验显著性水准取a=0.05,P<0.05有统计学意义。结果:1 PLCE1基因rs2274223(A/G)等位基因有(AA、AG、GG)三种分型,rs17417407(G/T)等位基因有GG、GT、TT三种分型。对照组中两个位点的基因型频率分布都符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。2 PLCE1基因rs2274223(A/G)位点多态性与直肠癌关联关系PLCE1基因rs2274223位点上等位基因A和G在直肠癌组中出现频率为68.12%和31.88%,对照组中为78.57%和21.43%,两组分别相比,认为直肠癌和对照组的差异有统计学意义(P<0.05)。在直肠癌组中A/A、A/G、G/G和AG+GG基因型出现的频率分别49.28%、36.23%、14.49%和50.72%,在正常对照组中分别为61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例组与对照组中GG、AG+GG基因型分别与AA基因型相比较,差异均有统计学意义(P分别为0.003、0.032)。携带GG、AG+GG基因型与直肠癌的发生有相关性(OR=3.824,95%CI=1.529-9.559;OR=1.673,95%CI=1.044-2.680)。3 PLCE1基因rs17417407(G/T)位点多态性与直肠癌关联关系:PLCE1基因rs17417407(G/T)位点上等位基因G和T在直肠癌组中出现频率为81.52%和18.48%,在正常对照组中为79.59%和20.41%,表明在直肠癌与对照组的对比中,差别无统计学意义(P>0.05);在直肠癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型频率为69.57%、23.91%、6.52%、30.43%,对照组为64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例组与对照组中TT、GT+TT基因型分别与GG基因型相比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。4 PLCE1基因rs2274223(A/G)位点多态性与结肠癌关联关系PLCE1基因rs2274223 A和G等位基因在对照组中为78.57%和21.43%,结肠癌组中的频率70.10%和29.90%,两组相比较,差异有统计学意义(P<0.05)。在结肠癌组中基因型A/A、A/G、G/G和AG+GG的频率为:49.02%、42.16%、8.82%和50.98%,在对照组中为:61.90%、33.33%、4.76%和38.10%,病例组与对照组中AG+GG基因型分别与AA基因型相比较,差异有统计学意义(P<0.05)。携带AG+GG基因型与结肠癌的发生有相关性(OR=1.690,95%CI=1.013-2.818)。5 PLCE1基因rs17417407(G/T)位点多态性与结肠癌关联关系PLCE1基因rs17417407(G/T)位点上等位基因G和T在结肠癌组中出现频率为76.47%和23.53%,在正常对照组中为79.59%和20.41%,表明在结肠癌与对照组的对比中,差别无统计学意义(P>0.05);在结肠癌中GG、GT、TT、GT+TT基因型出现的频率分别为62.75%、27.45%、9.80%、37.25%,在正常对照组中则为64.63%、29.93%、5.44%、35.37%,病例组与对照组中TT、GT+TT基因型分别与GG基因型相比较,差异均无统计学意义(P>0.05),6 PLCE1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)两SNP s位点联合分析采用EH软件和2LD软件对直肠癌组和结肠癌组分别与对照组中PLCE1基因rs2274223(A/G)和rs17417407(G/T)两SNP s位点进行联合分析。显示PLCE1基因两SNP s位点在直肠癌组与对照组之间存在着连锁不平衡(D’=0.119),人群中单体型rs2274223G-rsl7417407T增加直肠癌的发病风险(OR=2.413,95%CI=1.279~3.819);单体型rs2274223G-rsl7417407G增加结肠癌的发病风险(OR=1.130,95%CI=1.052~2.425),而rs2274223G-rsl7417407T单体型降低结肠癌的发病风险(OR=0.837,95%CI=0.536~0.934)。其他单体型与CRC的发病风险可能无关。结论:1 PLCE1基因rs2274223(A/G)SNP可能与CRC的发病风险相关,携带AG+GG基因型增加了CRC的发生风险;携带等位基因G可能是中国北方人CRC发病的一个易感基因标志。2 PLCE1基因rs17417407(G/T)SNP与CRC的发病风险无关。3 PLCE1基因两SNP s位点在直肠癌组和结肠癌组均与对照组之间连锁不平衡(D’=0.119),人群中单体型rs2274223G-rsl7417407T增加了直肠癌个体的发病风险;rs2274223G-rsl7417407G单体型增加结肠癌的发病风险,而单体型rs2274223G-rsl7417407T降低结肠癌的个体发病风险。其他单体型CRC的发病风险可能无关。
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