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猪圆环病毒病(Porcine circovirus diseases, PCVD)包括由猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2, PCV2)引起的一系列猪病,例如断乳仔猪多系统衰竭综合征(Postweaning multisystemic wasting syndrome, PMWS)和猪皮炎与肾病综合征(Porcine dermatis and nephropathy syndrome, PDNS)等。PCV2主要因其侵害机体的免疫系统,导致免疫抑制,继而造成继发感染,因此猪圆环病毒病给养猪业造成了巨大的经济损失。猪圆环病毒引起了全世界兽医学者的普遍关注,相继进行研究。本研究对2009-2011年间采集自华东地区送检的疑似PMWS猪血液或组织样本进行PCR检测,掌握华东地区的PCV2流行情况；通过分离鉴定PCV2流行毒株和PCV2毒株的ORF2基因的比较分析,掌握PCV2地方株的多样性和特性。本研究包括两部分内容：1.应用PCR检测方法,对2009-2011年采集自山东、安徽、江苏、上海、浙江、江西、福建7省市426份疑似PMWS猪血液和组织样品进行检测。结果显示,华东地区426份病料中,有230份为PCV2阳性,阳性率为54.0%；7省市送检的样品中均能检测出PCV2阳性样品,其中浙江阳性率最高为59.5%,福建阳性率最低为48.0%。结果表明华东地区猪群中普遍存在PCV2感染,且感染率较高。2.选取来自山东、安徽、江苏、上海、浙江、江西、福建7省市的24份PCV2阳性病料,经处理后接种pK-15细胞,并进行传代。传代过程中用PCR对分离株进行鉴定,扩增PCV2特异性目的条带,证实获得了16株PCV2分离株。间接免疫荧光检测结果进一步证实了16株PCV2毒株在pK-15细胞中获得了增殖。通过对16株PCV2分离株进行全基因组序列扩增、克隆和测序,获得了16株PCV2分离株的全长基因组序列。对这16株PCV2分离毒株与24株代表性PCV2毒株进行ORF2基因同源性分析、系统进化树分析和氨基酸序列分析。ORF2基因同源性分析结果表明,16株PCV2分离毒株与GenBank中其他24株已知参考毒株的ORF2基因同源性介于83.7%-100%之间,与华东地区21株已知参考毒株的ORF2基因同源性介于88.0%-100%之间,16株PCV2毒株之间的ORF2基因同源性为88.0%-100%。基因型分析结果显示,2009-2011年华东地区PCV2毒株存在3个基因型,即PCV2a、PCV2b和PCV2d, PCV2d基因型相对PCV2a和PCV2b更为流行,但与地理位置无明显相关性；ORF2氨基酸序列分析结果表明,16株PCV2分离毒株与GenBank中其他24株已知参考毒株相比,ORF2编码的Cap蛋白存在3个变异度较高的主要区域53-91aa.121-151aa和190-215aa,且相关抗原表位区域存在变异。这些突变位点是否影响病毒的生物学特性,还有待于进一步研究。通过本研究掌握了华东地区猪群中PCV2的感染状况和PCV2地方流行株的多样性和特性,为疫苗株的筛选提供科学依据,为有效防控猪圆环病毒病奠定了理论基础。