独立审计产生于两权分离条件下改善所有者和经营者之间的信息不对称,进而改善公司治理效率的需要。随着企业规模的扩大、经营的复杂化以及筹资渠道的多样化,两权分离导致的代理冲突和信息不对称程度也日益加深,企业内部治理对于改善这种状况的作用往往是有限的,更加需要独立审计作为一种外部治理机制进行补充。在我国这样的新兴资本市场上,高股权集中度和国有股占主体是上市公司的一个普遍特征。高股权集中度产生了大股东和中小股东之间的代理冲突,这种代理冲突的表现是大股东侵害中小股东利益的行为在我国资本市场上时有发生,给我国资本市场造成了巨大的损失,严重扰乱了资本市场的秩序,制约了经济的健康发展。因此,大小股东代理冲突是我国公司治理问题的研究中不容忽视的重要变量。那么结合我国资本市场的特征,公司治理效率会对独立审计产生什么样的影响呢?独立审计在我国实施若干年以来有没有对改善大小股东代理冲突提高公司治理效率产生应有的作用呢?以往的研究大多是从审计需求的角度去证明独立审计具有公司治理的作用,研究的角度也比较单一。本文采用理论研究和实证研究相结合的方式,以净资产收益率和大股东资金占用分别从治理收益的角度和从治理成本的角度作为衡量公司治理效率的替代变量,从两个方面进行研究。第一个方面的研究是以公司治理效率的两个指标作为解释变量,再分别以审计意见类型和审计师类型作为被解释变量研究了公司治理效率对审计意见的影响以及是否存在高质量的审计需求；第二个方面的研究是以上年度的审计意见类型和审计师类型作为解释变量,再分别以本年度和上年度之间的大小股东代理冲突变动值和公司治理收益变动值作为解释变量研究了独立审计的结果是否得到了积极的反应促进了公司治理效率的提高。两个方面的实证研究综合起来得出了以下结论：1、大小股东间的代理冲突确实是影响审计治理作用的重要因素；2、我国审计市场虽然存在很多问题需要改进,独立审计时常会变的不“独立”,但不可否认的是在长期仍然对上市公司治理效率的提高和资本市场的完善产生了一定的积极作用；3、独立审计作用的发挥,需要良好的公司内部治理机制为基础。