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卤代甲烷的生物合成机制已经被发现,由以下酶促反应完成:SAM (S-adenosyl methiomine) +X_(Cl-, Br-, I-)→CH3X+SAH(S-adenosyl homocysteine),反应由一种甲基转移酶(Methyl Chloride Transferase,MCT)催化完成。模式生物——拟南芥也产生和释放卤代甲烷,行使此功能的主要的酶是由HOL(HARMLESS TO OZONE LAYER)基因编码的,该酶属于甲基转移酶家族,能催化依赖SAM的Cl-、Br-、I-