在经济全球化与区域经济一体化趋势下，面对全球范围内人才争夺、技术转移和资金流动的加快，两岸高新技术产业发展面临着日益激烈的国际竞争。两岸需通过合作来发挥各自在高新技术产业环节上的优势，合理配置经济资源，制定适时有效的发展策略。　　 本文在两岸高新技术产品贸易往来深化、高新技术产业投资迅速增长的基础上，阐述两岸高新技术产业合作的路径与模式，以及两岸的加工制造生产模式在全球产业链中的地位。由现状揭示出目前两岸高新技术产业合作中存在的问题，包括两岸资源流动不畅、合作模式承受压力、台资回撤现象严重、两岸产业差距较大、两岸技术标准缺乏和两岸合作机制不完善。文章进一步分析两岸加强高新技术产业合作存在着必要性和可行性，即两岸可在高新技术产品贸易和投资上深入合作，拓宽领域，加强研发合作。最后，针对目前存在的问题及未来发展的方向，提出适时建议。