漳卫南运河水资源总量少、时空分布不均、经常出现连续枯水年。水资源开发利用工程体系完整，已经超出水资源承载能力，水生态环境恶化，出现径流衰减、河道断流、入海水量少、地下水超采、水质恶化、河道底质污染等生态问题。水资源配置现状存在对地下水依赖程度高、超采严重、上游取用水比例高、生态用水被挤占挪用、农业用水比重高、浪费严重、跨流域调水无序等特点，在基础设施、规划、利益、污染、管理方面存在一些问题。按照现状供水能力为基础、当地水资源承载力为基础、基于外流域调水进行平衡分析说明，现状供水能力不足，当地水资源承载力有限，最终只能依靠引黄、南水北调来解决流域缺水问题，但遇枯水年依然存在水量不足。按照遵循资源共享、高效经济、统筹协调和持续利用的原则，合理抑制需求，保障有效供给，维持和改善生态环境，统筹安排好生活、生产和生态用水。根据漳卫南运河水资源配置现状和不同区域范围的供水特点、需水特点以及自身条件，采取不同配置方案，在工程措施和非工程措施方面给予保障，实现预定目标。