因为国产星载钟起步较晚所以质量有待检验，故需要通过星载钟性能评估来检验国产星载钟性能，星载钟性能评估对未来星载钟研发具有借鉴作用。　　 目前比较常用的星地钟差算法是轨道反演算法，轨道反演算法需要多站协作进行联合定轨来计算星地钟差，但因GEO卫星机动时无法定轨，故轨道反演算法不能持续性计算星地钟差。本文中采用方法是利用北斗直发测伪距数据与转发测距数据进行融合处理来计算星地钟差，该方法不需要定轨，故卫星机动时可使用，且单站即可计算星地钟差。星地双向时间同步伪距比对法需要在卫星上添加专用设备，而本文中采用的星地钟差法不需添加专用设备。　　 “北斗二号”卫星导航系统G3星星载原子钟在轨性能评估是由北斗直发测伪距数据设备，转发测距设备以及地面数据系统组成，星载原子钟为国产铷钟。　　 本文中采用的钟差测量方法是利用转发测距设备接收信号生成转发测距数据，同时利用直发式测伪距设备接收信号生成伪距数据，数据汇聚到数据中心，设计了融合处理算法，该算法的过程是：通过不含GEO导航卫星钟差的转发测距值与包含星地钟差的直发伪距值进行计算得到星地钟差。　　 在此基础上，以UTC(NTSC)为理想钟，通过算法计算GEO导航卫星星载原子钟的频率准确度，频率稳定度及频率漂移率等参数，再根据这些参数评估“北斗二号”卫星导航系统G3星星载原子钟在轨性能。　　 经过计算得到如下结果：　　 (1)北斗卫星导航星载原子钟(G3星)频率准确度处在10-11数量级。　　 (2)北斗卫星导航星载原子钟(G3星)100s稳定度处在10-11数量级1000s稳定度处在10-12数量级日稳定度处在10-13数量级　　 (3)北斗卫星导航星载原子钟(G3星)频率漂移率处于10-12数量级