技术创新是一国经济保持可持续发展的核心动力。我国“十四五”规划已经明确创新在经济社会发展建设全局中的战略地位,而金融作为提高资源配置的关键手段,主要包含三个维度:分别是金融结构的优化、金融规模的扩张和金融效率的提升,这三个维度都会对区域技术创新产生巨大的推动效应。金融结构发展一直是制约我国企业技术创新的重要因素,从而在一定程度上影响了经济发展质量。纵观现有研究,针对金融发展与技术创新关系的研究,主要基于国家或者区域（东部、中部和西部）的宏观层面。而本文利用系统聚类分析法从经济发展与金融发展两个维度将全国分为四组,研究金融结构对技术创新的影响,并将技术创新分为投入、产出和转化阶段,选取R&D研发投入的对数、专利授权数的对数以及技术合同数的对数为各个阶段被解释变量的代理变量,运用2007-2018年我国省域面板数据,对金融结构对技术创新的影响进行实证分析。分析结果表明:“银行主导型”的金融结构对我国技术创新的投入具有显著的促进作用,“市场主导型”的金融结构对我国技术创新的产出具有显著的促进作用,但无论是“市场主导型”还是“银行主导型”的金融结构对技术创新的转化均没有显著影响;分区域来看,“银行主导型”的金融结构对北京、上海、天津、江苏、浙江、福建、广东技术创新的研发投入有显著影响,且为正向的推动作用,对其余地区的研发投入无显著影响;“市场主导型”的金融结构对云南、甘肃技术创新研发投入有显著的促进作用,对其余地区的研发投入无显著影响。结合实证检验结果,本文从金融市场的多层次发展、金融风险的防范以及相关的法律法规等方面提出了相关政策建议。