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微量营养元素失衡已成为影响人类健康的最重要因素之一,给个人和国家及整个社会医疗体系带来沉重的负担。植物育种策略,尤其是籽粒富集矿质元素和花色苷水稻育种被认为是克服当前微量营养元素失衡的最经济和有效途径之一,对防治疾病、增进健康和延缓衰老具有重要的意义,因此急需要加强对控制籽粒高矿质元素含量和高花色苷含量基因的鉴定和研究。本研究利用“龙锦1号/香软米1578”杂交后代F3家系群196个株系,探讨了水稻籽粒Fe、Se、Zn、Cu、Mn、Ca、Mg、K、Na和P 10种矿质元素含量以及花色苷含量和重要农艺性状的遗传变异和相关关系,并对籽粒矿质元素含量、花色苷含量以及农艺性状进行了QTL定位分析,其研究结果如下:1.籽粒Na含量、花色苷含量呈现偏态连续分布,说明是由少数主效基因控制的数量性状外,所考察的其它性状均呈现接近正态的单峰连续分布,说明这些性状是由多基因控制的数量性状。2.籽粒Fe与Se、Mn与Na、Mg与Na含量呈显著或极显著负相关,而Zn与Fe、Cu含量,Mn与Mg、Ca、K、P含量,Ca与Mg、K、Na、P含量,Mg与K、P含量,P与K、Na含量均呈显著或极显著正相关。籽粒花色苷含量与Mn、Ca含量均呈极显著正相关。籽粒Se含量与秆长、穗长均呈显著负相关;Mn含量与千粒重呈显著负相关;Ca含量与穗总粒数、千粒重分别呈显著正相关和极显著负相关;Mg含量与千粒重呈显著负相关;K含量与千粒重呈极显著负相关;Na含量与秆长呈显著正相关;P含量与千粒重呈显著负相关。籽粒花色苷含量与千粒重呈极显著负相关。秆长与穗长、有效穗数、穗总粒数、千粒重均呈极显著正相关;穗长与穗总粒数、千粒重均呈极显著正相关;穗总粒数与千粒重呈显著正相关。3.利用区间作图法,构建了一张含有95个SSR标记的遗传连锁图谱,覆盖水稻基因组约1637.3 cM,标记间平均距离为17.23 cM。4.共检测到与籽粒Fe、Se、Zn、Cu、Mn、Ca、Mg、K、Na和P 10种矿质元素含量相关的QTL 45个。这些QTL包括与Fe含量相关的QTL 7个,分布于第2、4、5、6、8、9、11染色体上,对表型变异的解释率范围为3.57%～5.75%;与Se含量相关的QTL7个,分布于第1、2、7、10染色体上,对表型变异的解释率范围为3.96%～10.59%;与Zn含量相关的QTL 5个,分布于第1、3、7、8、12染色体上,对表型变异的解释率范围为4.00%～6.86%;与Cu含量相关的QTL 4个,