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目的:肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是世界五大常见癌症之一,每年约50%的新发病例发生在我国,位列我国恶性肿瘤死因第三位。尽管我国HCC的诊断和治疗水平与预后同以往相比有了明显改善,但总体治疗效果依然亟待提高。近年来,肿瘤分子靶向治疗快速发展,但在HCC治疗领域,多靶点药物索拉非尼和瑞格非尼仍然是目前仅有的经过FDA和CFDA批准的分子靶向药物,但临床应用存在有效率低、缺乏有效预测标志、副作用较大和易继发耐药等不足问题。因此,寻找HCC治疗的潜在分子靶标具有极其重要临床意义。本研究目的在于筛选HCC中表达上调最为明显的基因谱,为HCC分子靶向药物研发提供依据。方法:采用Affymetrix U133 Plus2.0技术平台检测93例HCC及配对癌旁肝组织的全基因表达谱,筛选在HCC中异常高表达基因。基因表达水平经log2对数处理后,用`x±s表示,通过配对t检验比较HCC与配对癌旁肝组织的每个基因mRNA表达水平,以P<0.001为具有统计学意义,筛选表达差异最为显著的Top10基因。基因表达与临床病理学因素的相关性分析用χ2检验,以P<0.05为具有统计学意义。基因表达数据处理采用GCOS1.4软件,统计分析采用R 3.01版和STATA 13.0版软件。结果:1、HCC中Top10过表达基因通过对93例HCC及配对癌旁肝组织的基因表达谱对比分析发现,HCC中表达上调最为显著的10个基因分别为:CDKN3、CCL20、PTTG1、MELK、PRMT1、TOP2A、TPX2、SMYD3、TMEM106C和UCK2,上调倍数25.244.6倍(均P≤2.0×10-22)。2、基因表达与临床病理学因素的相关性以基因中位表达水平为界值,将93例HCC分为高表达和低表达2组。通过CDKN3、CCL20、PTTG1、MELK、PRMT1、TOP2A、TPX2、SMYD3、TMEM106C、UCK2等Top10基因与年龄、性别、术后AFP水平、HBV感染、肝硬化、肿瘤数目及大小、血管侵犯、肿瘤包膜、Edmondson-Steiner分级、TNM分期等临床病理学参数相关性分析发现,CCL20、PRMT1和UCK2基因高表达与血清高AFP呈正相关;CCL20、PTTG1、PRMT1和UCK2基因高表达与组织学Edmondson-Steiner高分级呈正相关;CCL20基因高表达与高TNM分期呈正相关（均P<0.05）。SMYD3基因高表达与慢性乙肝感染、无血管侵犯呈正相关（均P<0.05）。CDKN3、MELK、TPX2、TMEM106C等基因表达与纳入临床病理学参数均无显著性相关（均P>0.05）。结论:1、本研究筛选出HCC中表达上调最为显著的Top10基因:CDKN3、CCL20、PTTG1、MELK、PRMT1、TOP2A、TPX2、SMYD3、TMEM106C和UCK2。其中CCL20、PRMT1、UCK2、TOP2A和PTTG1高表达与HCC不良生物学特征有关。2、以CDKN3、CCL20、PTTG1、MELK、PRMT1、TOP2A、TPX2和SMYD3等8个基因作为靶标的特异性抑制在既往研究的多种肿瘤中显示出抗瘤活性,提示以这些基因为靶点的HCC分子靶向治疗具有潜在临床应用前景。3、TMEM106C和UCK2基因在HCC中异常高表达,系国内外首次报道,为HCC分子靶向药物研发提供了潜在靶点。