贵州地方稻种资源遗传多样性及重要品质的遗传解析

来源 :贵州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:echo_1978
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贵州省是稻种资源大省,独特的地理位置和地貌条件造就了多样化的气候生态环境,同时孕育了品质优良,抗性较好的地方水稻资源。作物种质资源及其遗传多样性的丰缺是挖掘优良基因与培育新品种的重要基础,为了更贴合现代育种需求,对贵州地方水稻品种资源进行研究,充分挖掘和利用其遗传潜势,以实现种质资源优势向基因资源优势的转变,为贵州省的水稻优质育种工作提供理论依据和材料支撑。本研究对273份贵州地方水稻种质资源的遗传多样性和群体遗传结构、主要品质性状特性评价、淀粉合成相关基因多样性、淀粉合成相关基因与蒸煮食味品质性状的关联分析等4个方面进行探究,主要研究结果如下:(1)利用53对SSR引物对来源于贵州省内多个地区的273份地方水稻种质进行遗传多样性和群体结构分析。研究结果表明,53个SSR标记共检测到182个等位基因,每个位点的等位基因数变化范围为2~6,平均为3.43;平均有效等位基因数为2.0145;Shannon信息指数变化范围为0.2620~1.5828,平均为0.7788;Nei’s基因多样性指数变化范围为0.1333~0.7723,平均为0.4325;多态信息含量变化范围为0.1266~0.7366,平均为0.3680。基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析将273份水稻划分为2个类群,分别包含240和33份材料;Structure群体结构分析结果划分为2个类群,分别包含242和31份材料;其中262份(95.97%)材料的Q值≥0.9,仅2份材料Q<0.6,划分到混合群。群体结构分析结果与UPGMA聚类结果大致相同。(2)品质性状的变异分析表明供试材料的垩白粒率、垩白度、直链淀粉含量、胶稠度、碱消值、吸水性、延伸性、膨胀性等8个品质指标的离散程度较大。贵州地方水稻种质资源绝大多数属于中、高直链淀粉含量,中、硬胶稠度,中、高糊化温度。品质性状的相关性分析表明糙米率、精米率、整精米三者两两之间呈极显著正相关;糙米率、精米率、整精米率都与垩白度呈极显著负相关;直链淀粉含量与胶稠度、碱消值呈极显著负相关;吸水性、延伸性、膨胀性三者两两之间呈极显著正相关。品质性状的主成分分析表明,可通过4个主成分对品质性状的大部分相关信息进行概括,分别为外观因子、理化因子、加工因子和垩白因子,4个主成分的累计贡献率为70.609%。(3)利用20个淀粉合成相关基因的58个标记位点对贵州地方稻种资源进行淀粉合成相关基因多样性分析,共检测到126个等位基因,每对标记的等位基因数变化范围为1~4,平均为2.17;有效等位基因数变化范围为1.0000~3.1081,平均为1.3850;Shannon信息指数变化范围为0~1.2456,平均为0.3841;基因多样性指数变化范围为0~0.6783,平均为0.2224;多态性信息指数变化范围为0~0.6239,平均为0.1921。淀粉合成相关基因的UPGMA聚类分析,把273份水稻划分为2个类群,分别包含243和30份材料。20个淀粉合成相关基因共检测到97种单倍型,单倍型最少为2种,最多为10种。(4)利用20个淀粉合成相关基因的58个标记位点与273份贵州地方水稻种质资源的蒸煮食味品质性状进行关联分析表明,GLM检测到29个标记位点,MLM检测到20个标记位点,GLM和MLM关联分析检测到18个相同的标记位点与直链淀粉含量、胶稠度、碱消值、吸水性、延伸性、膨胀性等6个品质性状关联。PUL基因启动子和第9内含子的变异对胶稠度和吸水性变异的解释率最高,分别为3.88%和3.43%;GBSSⅠ基因第6外显子的突变对碱消值和延伸性变异的解释率最高,分别为6.02%和7.31%。
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