绩效审计从提出到现在已有半个多世纪,我国的绩效审计特别是科技开发风险基金绩效审计工作还处于探索阶段,对开展科技开发风险基金绩效审计的意义等方面的认识也不够全面,其具体实施中对审计的内容、操作程序、方法和绩效评价指标体系等尚未进行规范。因此,有必要对相关问题进行研究与探讨。本文把构建我国科技开发风险基金绩效审计理论体系作为研究目的,以期对我国逐步展开的政府绩效审计实践提供一点帮助。本文主要从理论方面出发,在分析政府绩效审计现状的前提下,借鉴了国内政府投资项目审计、政府绩效审计以及公共支出绩效审计的理论成果和实践经验。在具体研究方法上,以规范研究为主,以案例研究为辅,采用历史研究、比较研究等方法对科技开发风险基金绩效审计相关问题进行了研究和探讨。本文通过介绍科技开发风险基金的构成、管理特点及使用范围等对绩效审计的影响,分析其绩效审计的审计内容、审计程序及常用的审计方法。在此基础上,论文对科技开发风险基金绩效审计评价指标设计的基本原则和内容、评价指标的选取及具体评价指标的计算分析进行了深入的分析研究。本文在指标设计方面参考了财务效益评价指标、国民经济效益评价指标、社会效益评价指标、生态效益评价指标和科技开发项目的研发进度、研发或科技转化成果等技术经济指标,初步构建了科技开发风险基金绩效审计评价指标体系。然后通过对其他地方及A市政府投资科技开发风险基金案例分析,得出其绩效、分析其问题及提出改善对策。在上述研究的基础上,对如何完善我国科技开发风险基金绩效审计工作,提出了提高绩效审计人员综合素质、建立健全相关绩效审计相关规范体系、推行科技开发风险基金绩效审计结果公告制度、强化审计责任追究制度等对策,以期为审计机关和审计人员开展此项工作提供参考借鉴。