多种山羊流行病的发生一直困扰着海南黑山羊产业的发展。本研究首先对海南黑山羊6种疫病进行血清学调查,包括:副结核、羊口疮、布鲁氏菌病、魏氏梭菌病、传染性胸膜肺炎和巴氏杆菌病。研究方法主要应用ELISA检测。结果表明,在海南黑山羊中存在副结核、羊口疮、魏氏梭菌病、传染性胸膜肺炎和巴氏杆菌病,但未检测出布鲁氏菌病存在。本研究根据临床症状,利用分离培养、生化鉴定和分子生物学方法,成功分离并鉴定出D型多杀性巴氏杆菌和类鼻疽伯克霍尔德氏菌海南株。本研究对多杀性巴氏杆菌菌株进行药敏实验,发现其对甲氧苄啶一磺胺甲恶唑、左氧氟沙星、四环素、庆大霉素和阿莫西林敏感,对头孢他啶、红霉素中度敏感,对氟苯尼考耐药。最后,基于类鼻疽伯克霍尔德氏菌的致病性强及对大多数抗菌药物耐药特点,本研究提取了该菌的全基因组,利用Illumina Hiseq 4000平台结合Pacbio RSII平台的测序手段,成功获得羊源类鼻疽伯克霍尔德氏菌海南株的细菌全基因组,并对基因组进行功能注释、抗性基因分析及毒力基因分析,这为国内类鼻疽伯克霍尔德氏菌标准菌株的建立、早日研发有效的疫苗提供基因组信息支持。