水资源短缺成为影响新疆经济社会发展的制约因素,本文借鉴公共产品理论、供求理论、生产理论和利润最大化等理论,并在国内外农业用水研究的基础上,以2004-2013年新疆14个地州市的面板宏观统计数据为基础,基于CD生产函数的随机前沿分析方法(SFA)测算了新疆农业生产的技术效率,并在此基础上计算了新疆农业用水效率,利用受限因变量模型(Tobit模型)对影响新疆农业用水效率的主要因素进行实证研究。以典型区域农户实地调研数据出发,分析农户对农田灌溉的认知程度如何,不同灌溉技术对农户农地经营效益的影响有多大。最后基于本文研究结论从如何推进农业水资源管理制度改革方面出发、以提升新疆农业水资源利用效率的具体措施来提出相关政策建议。研究发现:(1)发现新疆农业用水效率远低于生产技术效率,但是近年来用水效率处于不断上涨的态势,不同地区的用水效率差异在明显缩小;新疆人均水资源占有量和地表水占供水总量的份额对农业用水效率有显著负向影响;农业有效灌溉面积、水库数量、人均GDP、棉花种植面积对新疆农业用水效率具有正向相关性;灌溉水费、全年降水量、全年日照时间及种植结构对各地区农业用水效率的影响方向不同,表明要视当地的情况合理规划农田水利设施,制定水价,安排农作物种植结构。(2)通过对典型区域农户调研情况发现,对灌溉水资源的认知方面,71%的农户能够认识到水资源的稀缺性,但是对于农业水价、水权的认知就不是很充分了,77.2%的农户不能认识到水资源价格偏低,对于农业水权买卖有57.35%的农户不愿意把节省下来的水资源进行买卖。通过对农户灌溉经济效益比较分析发现高效节水灌溉技术方式下作物的收益高于普通滴灌方式下的收益,更加高于漫灌方式下作物的经济效益,说明理性的农户采用高效节水灌溉技术可以在提高农户经济效益的同时提高农业用水效率。同时在同一种灌溉方式下经济作物的经济效益高于粮食作物的经济效益,优化种植结构能为农户带来经济利益但是要考虑粮食安全。