【摘 要】
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cDNA芯片结果的可靠性分析是芯片应用中十分重要的内容之一.该文通过同种组织RNA的自身比较实验以及不同组织RNA的差异分析实验对cDNA芯片实验的重复性进行检验,利用相关系数
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cDNA芯片结果的可靠性分析是芯片应用中十分重要的内容之一.该文通过同种组织RNA的自身比较实验以及不同组织RNA的差异分析实验对cDNA芯片实验的重复性进行检验,利用相关系数、变异系数和假阳性率分析cDNA芯片数据的可靠程度,并对cDNA芯片实验数据作了整体的评估.实验结果证实,该芯片系统得到的cDNA表达谱数据的相关系数一般大于0.9,平均变异系数在15％左右,假阳性率控制在3％以内.该文还利用一致率(consistence rate,CR)作为衡量cDNA芯片系统重复性的新参数,同时阐述了该参数优于目前常用的其它参数(相关系数及变异系数)的特点.另外,还通过比较芯片制备中点样浓度、mRNA和总RNA,以及不同批次芯片和不同标记过程对实验的影响,来分析芯片数据的系统误差来源.并提出重复两次实验,可以克服绝大部分实验系统引入的假阳性.
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