【摘 要】
：
本文通过EST生物信息学的应用,对已构建的新吉细毛羊cDNA文库进行活化,期望能够挖掘影响新吉细毛羊相关毛用性状的基因亦或可能选出起主导作用的主效基因。运用菌落PCR、菌液
论文部分内容阅读
本文通过EST生物信息学的应用,对已构建的新吉细毛羊cDNA文库进行活化,期望能够挖掘影响新吉细毛羊相关毛用性状的基因亦或可能选出起主导作用的主效基因。运用菌落PCR、菌液PCR、质粒快速鉴定等三种方法对 cDNA文库进行评价,通过测序,在NCBI上BLASTn搜索、比对及运用DNAstar等软件进行分析。初步鉴定的结果:cDNA文库的库容量(滴度)为1.57×106pfu·ml-1,菌落PCR、菌液PCR阳性克隆的小片段率在80％-90%,克隆的片段大小在0.6 kb-2.0 kb,cDNA在300 bp-500bp,而质粒快速鉴定的在90%,克隆的片段大小载体带3.5kb-5.0kb。质粒快速鉴定的效果稍好于其它两种方法,耗时相对短,同时小片段率稍高一些;cDNA文库保存完好,符合基因文库的质量要求,有足够大的库容量来保证筛选目的基因。通过对筛选的阳性克隆5’端随机测序,随后获得可读序列474条,经过相关生物信息学分析之后,发现其中可能含有完整基因,为进一步发现毛性状相关新基因奠定基础。利用DNAstar软件的SeqMan程序对获得了474条可读EST序列首先进行初步筛选和分析,进行前处理,再利用SeqMan中的Assembler进行重新组合、装配形成209个Singletons和57条Contigs。将这些获得的序列具有重叠部分进行ESTs整合后,可形成单一的簇(cluster)以达到EST聚类目的。通过把同一部分CDS或同一基因(或转录本)中具有相同的部分延长产生较长的一致性的用于注释的序列。经过这一系列的处理后,将大大降低数据的冗余性,从而减少不必要的重复性搜索。与Nr数据库进行Blastx比对,看是否为理想匹配,对于部分进行cDNA全长标注,为不理想的匹配继续进行下一步在Nt数据库中进行Blastn比对。
其他文献
目的:分析探索中西医结合治疗慢性稳定型心绞痛的临床疗效.方法:将2014年9月至2015年12月期间在我院进行治疗的60例慢性稳定型心绞痛患者作为研究对象,随机均分为观察组及对
目的:观察辨证分型治疗不孕症疗效.方法:使用前瞻性设计,90例住院及门诊患者予辨证分型治疗,分为肾虚(又分肾阴虚、肾阳虚)、血瘀、痰湿内阻、肝郁气滞等证型辨证分型治疗,均
目的:探讨分析采用TURP手术治疗的前列腺增生症合并前列腺炎症的病因.方法:选取我院2013年4月至2015年5月期间收治的50例TURP前列腺增生症合并的前列腺炎症患者作为研究分析
１９９１年对１５２份栽培大豆、１２份野生大豆、１２份半野生大豆进行了胚芽期酯酶同工酶分析。研究表明。不同类型大豆酶谱类型丰富，１７６份品种表现为１７个类型。按其迁移率可分为Ｅ１～Ｅ８８个大区。Ｅ４、Ｅ６和Ｅ７区酶带条数
目的:探究坦度螺酮配合电针治疗焦虑性失眠的临床疗效.方法:选择2014年5月～ 2015年10月于我院精神科接受治疗的100例已确诊为焦虑性失眠的患者作为研究对象,随机分为实验组和
转化糖是一种无色的澄清液体,主要用于需要非口服途径补充水份或能源的患者的补液治疗.氨茶碱适用于支气管哮喘、慢性喘息性支气管炎、慢性阻塞性肺病等缓解哮喘症状;也可用
玉米是印度重要的粮食作物,种植面积为58万公顷,总产量为100万吨,其中食用的占85%左右。最近几年用作耕畜青饲料的玉米种植面积有所增加,但总面积仍不超过20万公顷。在印度
目的:研究和探索抗骨增生片联合骨肽片治疗骨质增生症临床效果和应用价值.方法:选择我院2014年12月到2015年12月接收的骨质增生症患者166例,随机分为服用抗骨增生片的对照组
在改革、开放的大潮中,我国一些省辖市实行了市管县(市带县)的新体制。这一体制实行后,作为地市级的中心城市,不仅有公开发行的市报,而且还有公开发行的县报。像我们无锡市
目的:探讨羊水过多的临床护理.方法:对2014年6月～ 2015年6月收治的羊水过多患者35例临床护理措施进行分析.结果:35例羊水过多患者分娩婴儿共37例,其中双胎2例,巨大儿8例.结论: