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农业是国民经济的基础,开展农业可持续发展状况定量评估,跟踪分析农业生态经济系统发展动态,提出科学合理的发展建议,对维系国家永续发展和社会发展,具有十分重要的意义。本文以湖南农业生态经济系统为研究对象,应用能值理论和方法,对1994-2008年间湖南农业生态经济系统运行状况进行了动态研究,并对反映系统结构功能的能值指标及系统的可持续发展状况进行了比较分析。利用SPSS软件采用因子分析的方法,分析了湖南省农业生态经济系统能值产出的影响因素。研究结果如下：(1)湖南农业能值总投入平稳增加,由1994年的6.28E+22sej增加到2008年的6.92E+22sej,主要是因为工业辅助能值投入增加较大,而有机能值投入减少明显。(2)湖南农业能值总产出较大,增速较快,由1994年的1.75E+23sej增加到2008年的3.07E+23sej,增加了75.43%,表明湖南农产品产量大幅提高。(3)能值产投比增加明显,由1994年的2.79增加到4.43,净能值产出率由3.35增加到5.14,湖南农业生产效率比较高。(4)环境负载率由1994年的6.46增加到2008年的8.32,其中2003-2008年有所波动,但仍呈上升趋势,表明较大的经济能值的投入,导致环境污染比较严重。(5)人均能值产出量由1994年的8.26E+15sej增加到2008年的1.78E+16sej,人均能值净收益由1994年的5.30E+15sej增加到2008年的1.38E+16sej,表明农民收入稳步增加。(6)能值自给率由1994年的20%减少到2008年得16%,表明湖南农业生产对于自然资源的依赖性不大。(7)能值投资率由1994年的4.99增加到2008年的6.25,表明经济能值投入多,而环境资源能值投入相对较少,农产品具有一定的竞争力。(8)可持续发展指标由1994年的7.86降到2008年的5.96,其中有所波动,但仍然控制在6-10这个区间内,表明湖南农业具备可持续发展的条件。从投入与产出结构来看,湖南农业的能值总投入和总产出都比较高,湖南农业靠高投入获得高产出,特别是生猪、稻、油菜等农产品都位于全国前列,所占比重大,与湖南农业大省的地位比较符合。由于湖南农产品加工和制造并不发达,大多以初级形式流入市场,农民实际的收入并不高。从各项能值指标来看,能值自给率比较低；经济能值投入率、净能值产出率、环境负载率、能值投资率比较高；人均能值使用量、能值密度比较大；可持续发展性能比较合理。但是要保持农业可持续发展,必须提高对可再生资源的利用,减少农药、化肥、农膜等工业辅助能对于环境的压力。研究结果表明,湖南农业生态经济系统要进一步良性发展,应优化能值投入,合理利用辅助能,发展农产品加工业,提高净能值产出率。