ALDH2基因多态性与中国汉族人群帕金森病易感性相关研究

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背景:  帕金森病(Parkinson's disease,PD)是一种复杂的神经变性疾病,65岁以上的老年人帕金森病患病率为1-2%,帕金森病病因包括多种基因及环境因素,也包括二者复杂的交互作用。最近,Fitzmaurice等人研究发现醛脱氢酶(Aldehydedehydrogenase,ALDH)能够抑制如福美锌、苯菌灵和灭菌丹等农药的活性,这些农药的暴露史能够增加PD患病风险。他们进一步研究发现,基于5个单核苷酸多态性位点的乙醛脱氢酶(Aldehyde dehydrogenase2,ALDH2)基因单体型能够增强农药诱发PD的风险。但在该研究中,单体型以及单个多态性位点与PD的直接相关性没有得到证明。另外,ALDH2基因多态性在不同种族中变异十分大,rs671几乎只存在亚洲人当中。ALDH2酶活性对农药的易感性暗示了基因与当地环境因素存在潜在的相互作用。因此,在本研究中,我们通过在中国人群中分析单核苷酸多态性对ALDH2基因变异是否与增加PD发病风险相关进行研究。  目的:  探讨ALDH2基因多态性位点rs4767944、rs441和rs671以及由该三个位点组成的单体型与中国汉族人群PD的关联性。  方法:  通过HapMap计划和Haploview v.4.2软件,以参数r2阻断值大于0.8;平均等位基因频率大于0.1在中国北京人群中选取ALDH2基因的3个标签单核苷酸多态性位点(tag-SNP),即rs4767944(C/T),rs441(C/T),和rs671(A/G),借由聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、DNA测序分析和SHEsis软件分析的方法研究rs4767944、rs441和rs671多态性位点在584个散发性PD病人(310名男性和274名女性)和582个健康对照(294名男性和288名女性)的基因型情况以及由该3个位点组成的单体型情况;PD和对照组性别年龄匹配,均来是自于中国大陆东部的汉族人群。  结果:  1.无论是整体还是同性别间比较,rs671和rs441两个位点的基因型及基因频率在PD患者及对照组中并没有统计学差异。rs4767944则在整体以及同性别间有统计学差异:该位点的C等位基因在病例组中明显高于对照组(p=0.002,相对危险度[OR]1.302,95%置信区间[CI]1.102-1.537)。在对照组和PD患者里,C等位基因的频率分别是36.5%和42.8%,三种基因型CC、CT、TT的频率分别是10.7%、51.7%、37.6%和15.8%、54.1%、30.1%。在病例组中,CC基因频率的优势导致了三种不同基因型的分布不同,并可以认为是PD的一种风险因素。在同性别分组进行分析后,rs4767944在男性PD病人当中,基因型分布(p=0.023)和基因频率均有统计学差异(p=0.017,OR1.325,95%CI1.052-1.668)。  2.在以rs4767944、rs441和rs671为顺序的8个单体型中,我们排除了在病例组和对照组中频率均小于3%的单体型,剩下了C-T-A,T-T-A,C-C-G,T-C-G,C-T-G和T-T-G五种单体型。单体型整体分布具有统计学差异(p=0.01)。在C-T-A和C-T-G两种单体型的频率在PD患者中明显高于对照组,C-T-A在病人和对照中分别为3.4%和2.0%,C-T-G则是18.5%和14.2%,并且C-T-G在女性患者中也显著高于对照(p=0.011,OR1.527,95,95%CI1.100-2.121)。  结论:  总之,我们的研究结果证实了PD易患性与ALDH2基因多态性相关,rs4767944的C等位基因和C-T-A/G(rs4767944-rs441-rs671)能够增加PD的患病风险。进一步研究将集中在环境因素与ALDH2基因多态性和PD之间的相关性。
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