2000年,国务院转发科技部等部门《关于深化科研机构管理体制改革的实施意见》,提出了对社会公益类科研机构实行分类改革。2001年,国务院部门所属社会公益类科研机构分类改革启动,到2005年前后,国务院部门属社会公益类科研机构基本完成。一些省市也参照国家政策启动了社会公益类科研机构分类改革,包括甘肃、河北、吉林、江苏、福建、宁夏等十几个省(市、区)出台了社会公益类科研机构分类改革的政策。毋庸置疑,社会公益类科研机构经过长期改革取得了很大的成绩,推动了社会公益科研事业的发展。但就全国而言,地方社会公益类科研机构存在的一些共性问题并没有得到解决,改革进展缓慢。到目前为止,只有少数的省市基本完成了改革。如何解决我国地方社会公益类科研机构改革面临的问题,迫切需要加强研究。本论文从国家科技体制改革的大背景入手,首先阐述了社会公益类科研机构的内涵、特征和范畴,梳理了社会公益类科研机构改革的脉络,总结了中央部门属和各省市社会公益类科研机构改革的经验、教训,以湖南省社会公益类科研机构改革为例,深入分析地方社会公益类科研机构改革的现状、进展和面临的困境,找出制约地方社会公益类科研机构分类改革的瓶颈问题,提出了地方社会公益类科研机构改革的对策和建议。