【摘 要】
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【背景与目的】基因组DNA的非随机改变在胰腺导管腺癌(PDAC)的发生发展中起重要的作用,既往研究多局限于以细胞系为研究对象,利用BAC探针的array CGH鉴定基因组DNA非随机改变
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【背景与目的】基因组DNA的非随机改变在胰腺导管腺癌(PDAC)的发生发展中起重要的作用,既往研究多局限于以细胞系为研究对象,利用BAC探针的array CGH鉴定基因组DNA非随机改变。本研究通过寡核苷酸array CGH分析胰腺导管腺癌新鲜组织标本,寻找胰腺导管腺癌特异的DNA改变,筛选出可能与胰腺导管腺癌发生发展密切相关的DNA拷贝数改变和相应的基因。【材料与方法】收集2007年6月至2008年12月PDAC患者手术切除肿瘤组织标本15例,利用显微切割技术,富集肿瘤细胞,提取基因组DNA,通过array CGH分析,鉴定PDAC的基因拷贝数改变。应用荧光原位杂交(FISH)和实时定量PCR方法验证array CGH的结果。收集1999年～2008年间手术切除的PDAC65例,慢性胰腺炎8例,构建组织芯片,应用免疫组织化学(IHC)方法检测在array CGH中鉴定出的扩增基因PSCA和HMGA2的表达情况,分析其与PDAC临床病理参数的关系。【结果】Array CGH结果中,有11个增益频率在80%以上的染色体区段,分别为:1q31.3、3p22.1、3p22.31、3p22.3、8q24.3、10q11.23、14q12、16p13.3、17q24.1、Xp11.21和Xq28,其中包括畸变频率＞20%的高拷贝扩增基因80个。发现5个缺失频率≥80%的染色体区段,分别为:5p13.3、12q13.13、17p13.1、17q21.31、Xq11.1,其中包含畸变频率＞20%的缺失基因144个。Array CGH、FISH和q-PCR实验均表明8q24.3的PSCA基因扩增。IHC结果提示:PSCA和HMGA2在PDAC中的阳性表达率分别为67.2%和76.7%。PSCA和HMGA2的表达与患者年龄、性别、T分期、M分期、分化程度及预后无相关性,但均与淋巴结转移相关(PSCA:x~2=4.370,P=0.037;HMGA2:x~2=13.062,P=0.001)。【结论】PDAC基因拷贝数改变频率高、位点多,PSCA和HMGA2扩增和过表达可能作为PDAC淋巴结转移的分子标志。
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