黄瓜抗白粉病miRNAs的鉴定及功能分析

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黄瓜(Cucumis sativus L.),我国主要栽培的蔬菜作物之一,白粉病与枯萎病、霜霉病是危害黄瓜的三大主要病害。microRNAs(miRNAs)是一类长度20-24nt的内源非编码小RNA,通过互补配对原则降解或抑制mRNA,从而调控植物生命过程的相关生理活动。植物在生物胁迫和非生物胁迫下可以应激表达miRNA,并作用于逆境相关靶基因,使植物在生理反应上产生对胁迫的适应性。实验室前期以黄瓜高抗白粉病品系Jin5-508和易感白粉病品系D8为亲本创制了一系列染色体片段代换系,其中SSSL508-28高抗白粉病,且能稳定遗传。本研究以D8(高感白粉病,Powdery Mildew,PM)和SSSL508-28(高抗PM)为材料,利用miRNA测序技术比较了两者叶片在接种白粉菌48h后全基因组在转录水平上的差异miRNA,预测了相关靶基因,并利用荧光定量PCR对差异miRNA表达量进行了验证。主要研究结果如下:1、经过测序分析鉴定获得156种已知的miRNA和147种新miRNA。在D8的接菌与不接菌对比中获得32个差异表达的miRNAs,且在接种白粉菌后均上调表达,在SSSL508-28的接菌与不接菌的对比中获得6个差异表达的miRNAs,其中4个在接菌后下调表达。2、通过miRDeep2软件包和降解组测序方法,分别预测了 D8和SSSL508-28中鉴定的DEMs的517和20个靶基因。3、miRNAs的表达可能因品系或品种的不同而有很大差异,因此我们的研究突出了对PM的更广泛的基因型特异性反应,而不是对高抗和易感基因型的共同反应。4、Csa-miR395d-3p、Csa-miR398d、Csa-miR156j、Csa-miR160f、Csa-miR1 56g、Csa-miR172c-3p、Csa_novel-19 等 miRNAs 在 D8 中 PM 接种后上调,而在SSSL508-28 中 PM 接种后下调。其靶基因中 GRAS、DoF、eIF2α、PG、UGT、STPKs等转录因子亦在接种PM后差异表达。5、5个位于代换片段中的DEMs,包含在D8中两个上调的DEMs,即Csa-miR172c-3p 和 Csa-miR395a-3p,在 SSSL508-28 中两个下调的 DEMs,即Csa-miR395d-3p 和 Csa-miR398b-3p。一个 Csa-miR162a 靶向的编码 L-天冬氨酸氧化酶的基因,也位于同一片段上,并在D8用PM接种时下调。研究结果为今后进一步探究相关miRNA的抗白粉病机制及分子遗传改良、抗白粉病种质创新和利用奠定了初步的理论基础。
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