基于SSSL的水稻抽穗期QTL的鉴定和定位

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水稻抽穗期是很重要的农艺性状,它决定着一个水稻品种的地域适应性和季节适应性,是重要的育种目标之一。抽穗期受主效基因和微效多基因控制,基因之间存在复杂的互作,给抽穗期的研究带来很大难度。近年来发展起来的单片段代换系由于只带有供体亲本的一个片段,其它遗传背景跟受体亲本一致,可以作为永久群体进行多年和多点的重复试验,是进行基因定位、克隆和功能分析的优良材料。 本研究利用190份单片段代换系和23份次级单片段代换系进行抽穗期全基因组的鉴定和定位,这些单片段代换系的代换片段分布于12条染色体上,平均长度为15.8cM,在水稻基因组上的覆盖率为97%。2007年早晚季分别种植这213份材料以及对照华粳籼74,并利用t测验比较每份供试材料与华粳籼74的差异显著性,以P<10-5作为是否存在抽穗期QTL的标准,并利用代换作图法将抽穗期QTL定位在较小的区间上,同时对这些材料的叶龄和抽穗期之间的关系进行了分析。主要结果如下: 1、水稻叶龄和抽穗期之间呈极显著正相关,抽穗期随着叶龄的增加而延长。早季每增加1片叶抽穗期平均延长6.44天,晚季每增加1片叶抽穗期平均延长4.56天。 2、2007年早季鉴定出36个抽穗期QTL,2007年晚季鉴定出44个抽穗期QTL,2007年早晚季共鉴定出48个抽穗期QTL。其中,被定位在1cM-4cM间的QTL有12个,被定位在4cM一8cM间的QTL有13个,被定位在8cM-12cM间的QTL有8个,被定位在12eM-20cM间的QTL有11个,被定位在20cM以上的QTL有4个。 3、显性早熟基因的进一步定位。2006年晚季利用一个带有效应较大的早熟基因的单片段代换系与轮回亲本杂交,2007年晚季种植分离群体197株,其中157株早熟,40株晚熟,呈现明显的双峰分布。卡方测验显示x2(3:1)=2.07
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