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大豆[Glycine max（L.）Merr.]是重要的粮油作物,而大豆花叶病毒（Soybean mosaic virus,SMV）病是世界性的大豆病害,对我国大豆生产具有严重影响,会导致产量与品种的严重下降。培育和种植抗SMV大豆品种是防治该病害最经济、安全、有效的途径,因此对SMV进行抗性材料筛选、抗性基因/QTL定位及抗病候选基因的分析等方面的深入研究,将会较快推动大豆抗病分子育种研究进程。本研究对SMV株系进行了抗源筛选,获得了一批对SC3与SC7抗性较好的大豆材料,为抗性基因定位与抗SMV育种提供抗性种质。同时,为了鉴定大豆基因组中与SMV抗性相关的QTL/功能基因,本研究利用具有广泛表型变异的自然群体以及覆盖基因组的SSR与SNP标记,对大豆SMV抗性进行了关联分析,获得了一些与SMV抗性显著关联的位点,为抗病育种打下基础。在初步定位基础上,对RSC7进行了精细定位,对此区段内预测基因进行了实时荧光定量PCR（Quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR）分析,希望能确定SC7抗性基因,为抗病基因的图位克隆以及抗SMV育种奠定基础。主要研究结果如下:1.大豆对SMV株系SC3与SC7的抗源筛选本研究对包含育成品种以及地方品种的219份大豆品种接种SMV株系SC3与SC7,共筛选到对SC3抗性较好材料28份,占全部大豆品种的12.8%;对SC7抗性较好材料14份,占全部大豆品种的6.4%;其中同时对SMV株系SC3与SC7抗性较好的大豆品种数目为10份,占全部大豆品种的4.6%。筛选的优异抗源,对SMV抗性基因定位研究以及抗SMV育种具有重要作用。同时,研究结果表明育成大豆品种抗性要高于地方大豆品种。2.大豆对SMV株系SC3和SC7抗性与SSR的关联分析利用205对SSR标记对196份大豆材料的SC3和SC7抗性进行关联分析,在多个环境中鉴定到与其抗性显著关联SSR标记,研究结果表明:利用Q+K模型进行关联分析,共检测到40个SSR-抗性关联,涉及30个SSR标记,其中22个SSR位点与SC3抗性显著关联,18个SSR位点与SC7抗性显著关联,10个SSR位点与SC3以及SC7抗性均显著关联。在显著关联SSR位点中,稳定检测到2个SSR位点在所有环境中与SC3以及SC7抗性均显著关联。在检测到的与SC3抗性显著关联的SSR位点中,位于6和7号染色体上的SSR位点聚集在较近位置;而与SC7抗性显著关联的SSR位点中,也于6和7号染色体上聚集在较近位置。在鉴定到的10个与SC3以及SC7抗性均显著关联SSR位点中,位于6号染色体的SSR位点satt365、satt319和satt658,以及7号染色体上SSR位点CSSR306、sat316和satt201处于临近区域,表明这两个区域可能存在SMV抗性相关基因。3.大豆对SMV株系SC3和SC7抗性与SNP的关联分析利用筛选后的1142个SNP标记对191份大豆种质材料SC3与SC7抗性进行了全基因组关联分析。研究结果表明:191份大豆种质材料对SMV株系SC3与SC7抗性具有广泛变异;通过两种模型（Q+K以及PCA+K）共鉴定到37个SNP-性状关联,涉及31个SNP标记,其中14个SNP位点与SC3抗性显著关联,23个SNP位点与SC7抗性显著关联,6个SNP标记与SC3以及SC7抗性均显著关联。在检测到的与SC3抗性显著关联的SNP位点中,部分位于9、15、18以及20号染色体上的SNP位点聚集在较近位置;而在与SC7抗性显著关联的SNP位点中,部分位于3、8、18、19以及20号染色体上的SNP位点聚集在较近位置;同时与SC3以及SC7抗性显著关联位点中,位于18和20染色体上的SNP位点聚集在较近位置,这些区域可能存在与SMV抗性相关基因。4.抗性基因RSC7的精细定位利用抗性基因RSC7的初步定位结果,在目标区内通过加密标记对抗性基因R及SC7的进行精细定位,将RSC7定位在2号染色体上SSR标记BARCSOYSSR020621与BARCSOYSSR02063之间,物理距离小于200 kb。与大豆基因组数据库比对得知,在此区段内含有15个预测基因,包含一个LRR基因,一个热激蛋白基因,一个丝氨酸羧肽酶基因。通过qRT-PCR对15个预测基因接种SC7后的表达情况进行分析,发现有11个基因在接种SC7后抗感品种间表达量有显著变化,为抗性基因图位克隆提供有效信息。