论文部分内容阅读
目的:研究广西地区人群RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)位点基因多态性的分布特征;分析RANTES基因-403G/A和-28C/G位点基因多态性与HBV背景下慢性肝炎(CHB)、肝硬化(LC)、肝癌(HCC)遗传易感性的关联性,为广西地区HBV背景下CHB、LC、HCC的预防及治疗提供新的遗传指标。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,对来自广西地区229例健康人(健康对照组)和413例HBV感染病人(101例CHB患者、83例LC患者、229例HCC患者)的RANTES基因-403G/A和-28C/G两位点进行基因分型,并用DNA直接测序法验证。采用直接计数法对R ANTES基因各SNP位点的基因型和等位基因频率进行计算。采用拟合优度卡方(x2)检验分析各SNP位点的基因型频率在各组中的分布是否符合哈-温平衡(HWE)。采用卡方(x2)检验或确切概率法对各SNP位点基因型和等位基因在各组之间的分布差异进行比较。采用logistic回归分析校正民族、性别、年龄、吸烟、饮酒、身体质量指数等混杂因素,计算比值比(Oddsratio, OR)和95%可信区间(Confidence Intervals, CI),对RANTES基因多态性与HBV背景下CHB、LC、HCC的患病风险进行关联性分析。采用在线SHEsis软件进行单倍型的构建和分析。结果:1. RANTES基因-403G/A (rs2107538) 和-28C/G (rs2280788)的基因型频率分布在各组中均符合HWE(P>0.05),说明本研究人群具有代表性和可比性。2.广西地区人群RANTES基因-403G/A(rs2107538)位点在存在GG、GA、AA三种基因型;-28C/G(rs2280788)位点存在CC、CG、GG三种基因型。总体而言,两个SNP位点基因型和等位基因的频率分布与其他亚洲地区人种相近,而与白色人种或黑色人种差异较大。3.在广西壮族人群,RANTES基因-28C/G(rs2280788)位点的遗传多态性与增加HBV相关HCC的致病风险有关:CG vs.CC,OR=3.044,95%CI,1.285-7.211; CG+GG vs.CC,OR=2.974,95%CI=1.284-6.892;和G vs.C.OR=2.491,95%CI=1.178-5.268.在广西汉族人群,RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)基因多态性与HBV相关CHB、LC.HCC的患病风险均无关(P>0.05)。4.在女性人群,RANTES基因-403G/A(rs2107538)位点的遗传多态性与降低慢性乙型肝炎的致病风险有关:GA vs.GG,OR=0.270,95%CI= 0.073-0.999:GA+AA vs.GG,OR=0.276,95%CI=0.081-0.940.在男性人群,RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)基因多态性与HBV相关CHB.LC.HCC的患病风险均无关(P>0.05)。5.RANTES基因-403G/A(rs2107538)位点和-28C/G(rs2280788)位点的基因多态性未见协同年龄、吸烟、饮酒等因素与HBV相关CHB.LC.HCC的致病风险有关(P>0.05)。6.RANTES基因-403G/A(rs2107538)和-28C/G(rs2280788)位点构建单倍型,共有C28A403、C28G403.G28A403、G28G403四种单倍型,但均分别与HBV相关CHB、LC.HCC的致病风险无关(P>0.05)。结论:RANTES基因-28C/G(rs2280788)位点CG基因型和G等位基因可能是广西壮族人群HBV感染后肝癌发生的危险因子;RANTES基因-403G/A(rs2107538)位点GA基因型可能是女性人群慢性乙型肝炎的保护因子。