党的十八大以来,我国在农业供给侧结构性改革方面做了大量工作,提出绿色发展理念,这为我国有机农业乃至整个有机产业提供了难得的历史发展机遇,加上食品安全、生态安全等问题日益突出,云南省结合自身实际情况,把握资源与环境优势,扬长避短,大力发展高原特色有机农业,集全省之力在未来几年专注打造“绿色食品”这张牌。而有机认证作为高原特色有机农业发展的基础,是打造“云系”农产品品牌的有效手段,若这一环节出现问题,不仅是对云南高原特色有机农业信用的一种侵害,更是对广大消费者的一种欺骗与不负责,因此保证有机认证在高原特色农业中的实施质量具有重要意义。本文以研究云南省高原特色农业在实施有机认证过程中存在的问题为目标,在构建云南省有机认证实施质量评价体系的基础上,运用主成分分析、灰色评价、博弈论等方法,开展了以下工作:(1)在查阅大量有机认证相关文献的同时,整理掌握的云南省“有机产品认证示范创建区”相关评审材料,将理论研究与实际情况相结合,筛选确定出云南省有机认证实施质量评价体系。(2)根据专家评分利用主成分分析将多个指标重新分类,将新的分类所表达的相似含义重新命名,使其作为新的评价指标;然后利用灰色评价法将所有专家的评分转化为“较好”“好”“一般”“差”这四个灰类,在计算每个评分的白化权函数后,得到每个新指标的灰色权向量,进而求得每个新指标的灰色评价值,按照分值大小排序,分值最低的指标所包含的项可视为云南省有机认证实施中问题表现较为突出的部分。不仅如此,利用灰色评价法还将得到云南省有机认证实施质量综合评价值,这一值可以反映出云南省有机认证实施的整体质量水平。(3)在分析了存在的突出问题后,文章分析导致问题产生的原因。本文以利益相关者理论为基础,分析政府与认证机构、政府与有机生产企业之间的关系对有机认证实施的影响,并利用博弈论分析认证机构和有机生产企业的博弈策略选择及其对消费者的影响。(4)在以上问题研究和原因分析的基础上,就云南省今后提高有机认证在高原特色农业中的实施质量提出相应的对策建议。