基于微卫星和线粒体基因的中国西北地区狼的分子生态学研究

来源 :曲阜师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:adamsilei
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狼(Canis lupus)曾广泛分布在亚欧大陆和北美地区,是现存的最大的犬科动物。在我国,狼目前主要分布在新疆、西藏、青海、内蒙、四川西部和云南西北部等人口密度较小的偏远地区,而且呈现片段化分布。由于人类的干扰和栖息地的破坏,狼的生存现状越来越令人担忧,也受到越来越多的关注。本研究使用14对微卫星引物对内蒙、蒙古、新疆、青海和西藏5个地理种群的80个狼个体进行分析,同时对5个地理种群的74个狼个体的线粒体DNA的控制区(D-loop)和细胞色素b(Cytb)的部分序列进行系统分析。采用微卫星DNA和mtDNA两种不同的分子标记探讨5个地理种群狼的分子生态学问题。主要结果如下:1.筛选14对微卫星位点分析狼的5个地理种群的遗传多样性。结果显示,14个微卫星位点的等位基因的数目在5-20之间不等,平均为9.786个,多态信息含量PIC为0.740,各地理种群的等位基因数平均为5.6个,平期望杂合度0.6778,平均观察杂合度为0.6738。2.对狼的5个地理种群狼的线粒体HVRI和Cytb的部分序列分析。结果显示,5个地理狼种群中共检测出D-loop基因单倍型20种,Cytb基因单倍型19种。平均核苷酸多样性为0.1084和0.0065,变异位点占序列长度的比例为7.90%和10.18%。3.利用STRUCTURE软件的聚类结果,当K=2时,5个狼地理种群间的遗传结构最为清晰。根据STRUCTURE的结果,利用AMOVA软件对两个大居群的5个狼地理种群进行变异分析。结果显示,居群间的变异比例是11%,种群间的变异比例是5%,主要变异产生在种群内部,为84%。因此,中国西北地区的狼在各地理种群之间的遗传分化不显著,只是在两个居群之间存在一定的遗传分化。4.利用微卫星与线粒体数据对狼的5个地理种群构建系统发生树,结果表现一致,即青海与西藏两个地理种群聚为一支,而新疆、蒙古和外蒙三个地理种群聚为一支。5.根据Cytb基因分子钟原理,计算出5个地理种群狼的分歧时间,青海与西藏两个地理种群和新疆、内蒙和外蒙三个地理种群之间的分化时间在1.175-1.3MYA前。推断这一结果与青藏高原的隆起有关。6.从保护遗传学的角度,我们建议将我国西北地区狼划分为蒙新区和青藏区两个ESUs进行研究和管理。
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