大黄鱼养殖业是福建省沿海地区的支柱产业之一，在生产中常常出现同一批大黄鱼在鱼苗批次、饲喂条件、生活环境等条件相同的情况下，个体差异明显、部分鱼苗生长速度缓慢的现象。为探究原因，本试验选取福州市连江县某渔场同一网箱内同一批次投放的鱼苗，在相同养殖条件下饲喂300天的生长正常和生长缓慢两组大黄鱼，采用实时荧光定量PCR、消化酶活性检测和石蜡组织切片三种方法，分别测定肠道特征菌群数量、肠道消化酶活力、各肠段肌层厚度、肠绒毛长度、肠绒毛上杯状细胞和上皮内淋巴细胞个数，观察肝脏和肠道的组织形态结构等与消化吸收相关的因子，进行对比分析，从而探究在同等的人工饲喂条件下造成大黄鱼生长缓慢的原因。试验结果如下：　　1.生长缓慢组鱼肠道微生态菌群中机会致病菌酵母菌和致病菌弧菌两种菌数量明显高于生长正常组，生物统计分析结果显示两组间酵母菌数量差异显著（P＜0.05）。　　2.生长缓慢组鱼各肠段肌层较薄，肠绒毛稀疏，并有大量损伤，甚至出现脱落；生长正常组鱼各肠段肌层较厚，肠绒毛密集、修长且完整，未见明显损伤。生长缓慢组鱼前肠绒毛长度及肌层厚度显著低于生长正常组（P＜0.05）。肠道微生态菌群数量和组织结构形态比较的结果说明生长缓慢组鱼肠道健康状况较差。　　3.生长缓慢组鱼前肠绒毛上皮内淋巴细胞数显著高于生长正常组（P＜0.05）；而两组鱼前肠绒毛上杯状细胞数差异不显著（P＞0.05）。说明生长缓慢组鱼肠道内应激反应比生长正常组强烈。　　4.两组鱼肝脏细胞都有明显的空泡化，含有大量脂滴；细胞核出现降解；细胞膜降解，细胞之间界限不明显。两组之间无明显差异。肝脏细胞内含有大量脂滴说明两组鱼都患有近海小网箱养殖大黄鱼中常见的脂肪肝。　　5.两组鱼肠道内各消化酶活性比较结果差异不显著（P＞0.05）。　　上述结果表明大黄鱼生长速度差异与肠道微生态菌群、肠道组织结构形态和鱼肠道内应激反应有关。本研究结果为评估人工养殖大黄鱼健康状况、消化吸收水平，优化调整大黄鱼饲料配方和投喂方式，完善大黄鱼营养管理，提高其养殖效率提供数据支持。大黄鱼因子差异性