“十二五”规划对我国经济提出了科学发展的要求,要充分落实科学发展观,必须进一步加快转变经济发展方式。工业作为我国国民经济的主导产业,正面临能源消费总量居高不下、产能过剩现象严重、工业节能减排基础薄弱等一系列问题,缓解这些问题需要进一步提升工业节能减排效率,并有针对性地采取改进措施,促进我国工业经济的可持续发展。关于工业节能减排效率的研究,常用的方法是通过建立DEA模型进行测算,但由于传统DEA模型存在“黑箱”限制,本文采用突破“黑箱”限制的并行DEA模型,并在模型中融入非期望产出来测度我国工业节能减排效率。研究过程中将各省区作为主决策单元,其所辖地级市作为子系统,从地级市层面出发,运用纳入非期望产出属性约束的并行DEA模型测算我国2002-2012年的工业节能减排效率,并进一步将测算出的效率作为被解释变量,影响工业节能减排效率的若干因素作为解释变量进行影响因素分析。实证结果表明,单纯使用纳入非期望产出的非并行DEA模型测算出的效率值明显偏高,而纳入非期望产出属性约束的并行DEA模型所得到的效率值更加切合实际。总体来看,我国工业节能减排效率呈缓慢增长趋势,但效率水平偏低且各地区间存在差距。总体上单位工业增加值能耗和居民消费水平对工业节能减排效率的影响程度较大,其他因素也不同程度地影响效率水平。对东中西部分别进行分析发现,不同地区的影响因素显著性和显著关系均有差别。因此,我国工业节能减排形势严峻,地区间存在较大差异,工业的转型升级需要从更细致的层面因地制宜地制定相应政策,有针对性地提出改进方案,促进工业的包容性发展。