行政首长地域回避制度是指在一定级别政府中担任一定领导职务的公务员，要进行籍贯回避，不得在原籍任职的一项法律制度。行政首长地域回避制度既是预防公务员腐败行之有效的方法，是法治思想中自然正义理论、预断排除理论以及人民主权理论的具体体现，是建设法治国家不可或缺的重要法律制度。随着社会的发展，行政首长地域回避制度存在的问题凸现出来：在立法方面，原有立法理念有待改进，法律规定存在冲突，相关实体规定存在疏漏，相关程序规定流于形式；在执法方面，部分制度执行人员素质不高，相关执行配套制度不健全，行之有效的监督缺乏；在责任追究方面，行政责任追究机制执行不严格，举证责任分配不合理，刚性约束机制缺失，刑事司法行与政监察执法衔接不畅。导致该项制度存在诸多问题的主要原因是多方面的，有其思想观念因素，如儒家思想的影响、传统人情社会的束缚、部分制度执行者重视程度的不足；有其制度因素，如政党不分的现实困扰、政策导向的不合理；有其理论因素，如学术界对相关法律理论研究不足等。应完善我国行政首长地域回避制度：在立法方面，转变立法理念，建立任前公示制度，补充立法实体规定，拓展立法程序规定；在执行方面，加大相关配套制度建设力度，加强地域回避监督机制，提高公务员的素质；在责任追究机制方面，完善责任追究的程序和形式、合理分配举证责任、建立刚性约束机制以及增加责任追究机制之下公务员的救济以强化行政责任追究机制，密切刑事司法与行政监察执法的衔接。