甘蓝型油菜菜薹可溶性固形物及纤维组分含量的QTL定位与GWAS分析

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油菜是我国最重要的油料作物之一,甘蓝型油菜既可收籽榨油,也可以采薹作为鲜食蔬菜,潜力巨大。为选育品质优良的甘蓝型油菜菜薹品种,对其主要营养品质性状进行遗传解析至关重要。本研究通过对甘蓝型油菜菜薹的可溶性固形物(Soluble solids content,SSC)及纤维组分含量性状进行数量性状定位(Quantitative trait loci,QTLs)及全基因组关联分析(Genome-wide association analysis,GWAS),旨在挖掘控制品质性状的有利等位基因及优良亲本材料,为选育优良品种奠定基础。研究结果如下:1.本研究以包含189个株系的重组自交系(Recombinant inbred line,RIL)群体为材料,基于已构建的高密度遗传图谱对甘蓝型油菜菜薹SSC进行QTL定位;在2021南京(21NJ)和2021贵阳(21GY)两个环境中共检测到6个与SSC相关的QTL,分别位于A1、A4、A8和A9染色体上,单个QTL解释的表型变异率(Phenotypic variation,PV)为5.58%~12.92%,其中两个主要QTL q SSC/21GY.A4-1和q SSC/21NJ.A8-1的PV分别为12.92%和10.18%。同时,选取302份具有代表性的种质资源材料构成的自然群体,结合60K SNP芯片的基因型数据,对20NJ和21NJ两个环境下的SSC进行GWAS分析,基于混合线性模型,共检测到8个与SSC显著关联的位点,主要分布在A1、A5、A9、C1、C2、C3和C6染色体上,PV为5.62%~10.18%。对比QTL定位和GWAS结果,未在同一染色体区段检测出相同位点。通过对比油菜“Darmor-bzh”基因组,共鉴定出7个候选基因,其中Bna C02g20320D和Bna A09g41790D为2个重要候选基因。2.利用RIL群体,对甘蓝型油菜菜薹中纤维素、半纤维素、木质素含量进行QTL定位,分别检测到6,4和5个QTL,PV分别为5.26%~7.32%,5.38%~16.70%和6.67%~9.61%,检测到一个控制半纤维素含量的主效QTL q H/21GY.C3-1,PV为16.70%,此外,在C7连锁群上检测出一个同时控制纤维素含量和木质素含量的位点q C/21NJ.C7-1和q L/21NJ.C7-2,PV分别5.26%和6.77%。共鉴定出3个重要候选基因Bna C03g13110D,Bna A02g29640D和Bna A02g29340D。3.根据表型数据统计,在两群体中共筛选出3个高SSC的品系,RIL群体AH174(7.55°Brix和7.9°Brix),GWAS群体L166(8.9°Brix和8.38°Brix)及L380(8.9°Brix和7.74°Brix)。此外,在RIL群体中筛选出1个纤维组分含量均低的株系AH182,纤维素含量(6.97%),半纤维素含量(15.68%)和木质素含量(1.56%)。结合筛选的高SSC和低纤维组分含量表型数据,在RIL群体中筛选出AH120、AH169、AH182和AH194等4个株系可作为优良亲本材料。
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